当公司依法决定开除员工，但员工拒绝离开时，这是一个需要谨慎处理的问题，既要确保公司的正常运营秩序，又要遵循法律法规，避免引发不必要的法律纠纷。以下是我为您提供的详细解决方案：
一、确保解雇的合法性
首先，公司必须确保解雇决定是基于合法且充分的理由，如员工严重违反公司规章制度、不胜任工作且经过培训或调岗后仍无法胜任、被依法追究刑事责任等。同时，解雇程序也必须合法，包括提前通知员工、支付应得的经济补偿金（如适用）、出具解除劳动合同证明书等。
二、沟通协商与书面通知
沟通协商：
- 安排与员工进行正式面谈，详细解释解雇决定的法律依据和合理性，提供相关证据材料，如考勤记录、警告通知书、绩效评估报告等。
- 明确告知员工最后工作日及需办理的离职手续，包括工作交接、财物归还、社保转移等。
书面通知：
- 若口头沟通无果，公司应以书面形式发送《限期离职通知书》，明确解雇原因、生效日期、离职手续及逾期未办的后果（如停发工资、社保减员、追究法律责任等）。
- 确保通知书送达员工，如员工拒绝签收，可通过EMS等方式送达，并保留寄送凭证。
三、采取后续措施
限制员工权限：
- 根据公司规定，及时收回员工的门禁卡、工作账号密码、邮箱权限等，以防止对公司业务和信息造成损害。
- 在办公区域设置安保人员，确保员工不会滞留或干扰公司正常运营。
报警处理：
- 若员工持续滞留公司，干扰正常运营秩序，构成侵权或违反治安管理规定，公司可选择报警。
- 警方介入后，会根据实际情况进行调解或采取必要的法律措施，以确保公司秩序。
寻求第三方协助：
- 邀请工会代表介入调解，从维护员工权益和企业和谐稳定的角度出发，协助双方沟通，寻求妥善解决方案。
- 向劳动监察部门投诉，劳动监察部门具有监督企业劳动用工行为合法性的职责，其介入有助于推动问题的合理解决。
四、法律手段与风险防范
应对仲裁或诉讼：
- 若员工提起仲裁或诉讼，公司应积极应对，按照法律程序提供相关证据，如劳动合同、规章制度、考勤记录、解雇通知书等。
- 委托专业律师评估胜诉概率，制定应对策略，避免因程序瑕疵或证据不足导致违法解除的法律风险。
经济赔偿风险防范：
- 在处理过程中，公司必须确保行为合规，避免侵犯员工合法权益，否则可能面临经济赔偿的风险。
- 如因解雇程序不合规或解雇理由不充分而被判定为违法解除，公司需支付2N赔偿金（N为工作年限，每满一年支付两个月工资）。
五、预防未来纠纷的管理优化
完善规章制度：
- 明确界定“严重违纪”“不胜任工作”等条款，并通过民主程序公示，确保员工知晓并认同。
- 定期更新员工手册，增加“拒不离职的处理办法”等相关内容。
规范解雇流程：
- 建立解雇审批制度，由HR、法务、管理层多级审核，确保解雇决定的合法性和合理性。
- 解雇前进行背景调查，避免误伤受保护群体（如孕期女员工、工伤员工等）。
建立离职缓冲机制：
- 提供职业过渡支持，如推荐信、行业资源对接等，降低员工抵触情绪。
- 对高冲突风险的解雇案件，考虑第三方调解机构介入，协助双方平和解决纠纷。
综上所述，当公司依法决定开除员工但员工拒绝离开时，公司应确保解雇的合法性，通过沟通协商、书面通知、限制权限、报警处理及法律手段等步骤来妥善处理。同时，公司也应加强管理优化，预防未来类似纠纷的发生。