结论：被告提起反诉后，原告依然有权申请撤诉，但这一权利需在符合法定条件下行使，且撤诉并不影响被告反诉的继续进行。
详细分析：
原告撤诉的权利基础：
- 原告在诉讼过程中享有对其自身诉讼权利的处分权，这包括放弃或变更诉讼请求，以及撤诉的权利。这一权利是原告作为诉讼主体所固有的，即使被告已经提起了反诉，原告仍然可以根据自身的诉讼策略和实际需要，决定是否行使撤诉权。
撤诉的条件与程序：
- 时间条件：原告申请撤诉一般应在法院宣告判决之前提出。一旦法院对案件作出了判决，诉讼程序即告结束，原告也就失去了撤诉的机会。
- 程序条件：原告申请撤诉时，应向受理案件的人民法院提交书面或口头的撤诉请求。法院在接到撤诉申请后，会进行审查，主要考察撤诉是否违反法律法规的禁止性规定，是否会损害国家利益、社会公共利益以及他人合法权益等。如果审查通过，法院将准许原告撤诉。
撤诉的法律后果：
- 本诉的终止：如果原告的撤诉请求被法院准许，那么原告与被告之间的本诉诉讼程序将立即终止。这意味着原告在本诉中的诉讼请求将不再得到法院的审理和裁判。
- 反诉的继续：值得注意的是，原告的撤诉并不影响被告反诉的继续进行。反诉作为一个独立的诉讼请求，具有相对的独立性。即使本诉已经撤回，被告仍然有权继续其反诉程序，并寻求法院对其反诉请求的裁决。
撤诉的考虑因素：
- 撤诉对自身权益的影响：原告需要评估撤诉后是否会导致自身权益受到损害，以及这种损害是否可以接受。例如，如果撤诉后被告可能通过反诉获得更大的利益，原告就需要谨慎考虑撤诉的决定。
- 撤诉的法律依据和程序要求：原告需要确保自己的撤诉行为符合法律法规的规定，并按照正确的程序进行申请。否则，撤诉申请可能会被法院驳回。
- 反诉的可能结果：虽然撤诉不影响反诉的继续进行，但原告仍需考虑被告反诉的可能结果，以及自己是否有能力应对和反驳被告的反诉请求。如果反诉请求对原告构成较大威胁，原告可能需要重新评估撤诉的决定。
举例说明：
假设在一个合同纠纷案件中，原告起诉被告要求支付货款，被告则提起反诉要求原告赔偿因货物质量问题造成的损失。在诉讼过程中，原告可能因为各种原因（如双方达成和解、原告认为继续诉讼成本过高等）决定申请撤诉。此时，原告需要向法院提交撤诉申请，并等待法院的审查结果。如果法院准许撤诉，那么原告与被告之间的本诉诉讼程序将终止，但被告的反诉程序将继续进行。
特殊情况：
- 如果撤诉行为可能损害国家利益、社会公共利益或案外人的合法权益，法院将不准许撤诉。例如，在环境污染案件中，若原告撤销减免责任的本诉可能影响环境损害的赔偿和治理，法院将不予准许撤诉申请。
- 如果撤诉是为了逃避法律责任或规避不利裁判结果，法院也将驳回撤诉申请。例如，原告为拖延时间而提起诉讼，后在形势不利时申请撤诉，法院经审查认定其存在规避法律意图的，将不予批准。
建议：
在决定是否撤诉时，原告应充分权衡撤诉对自身权益的影响、撤诉的法律依据和程序要求以及反诉的可能结果等因素。如果案情复杂或原告对撤诉的后果存在疑虑，可以直接向我咨询以获取更具体的法律建议和帮助。