针对您提出的“种子包装不合法怎样处理”的问题，这确实是一个涉及法律法规的重要事项。根据我所了解的相关法律法规，以下是对这一问题的详细解答：
首先，我们需要明确的是，种子包装的合法性是受到严格监管的。如果种子包装不合法，比如应当包装而没有包装、包装上的标签内容不符合规定、伪造或涂改标签等，这些行为都是违法的，并会受到相应的处罚。
一、处罚依据
根据《中华人民共和国种子法》第六十二条的规定，对于经营的种子包装、标签不合法的行为，由县级以上人民政府农业、林业行政主管部门或者工商行政管理机关责令改正，并处以一千元以上一万元以下的罚款。这一规定明确了处罚的主体、对象和罚款的幅度。
二、具体处理措施
责令改正：一旦发现种子包装不合法，相关行政主管部门会首先要求经营者立即停止违法行为，并责令其改正。这可能包括重新包装种子、更换合法的标签等。
罚款：除了责令改正外，经营者还需要承担罚款的责任。罚款的金额根据违法行为的严重程度和造成的后果来决定，但最低不少于一千元，最高不超过一万元。
没收种子和违法所得：在某些情况下，如果违法情节严重或者造成了较大的社会影响，相关行政主管部门还可能没收经营者的种子和违法所得。
三、建议与预防
为了避免种子包装不合法带来的法律风险和经济损失，我建议您：
加强法律法规学习：作为种子经营者，应该深入了解并遵守《中华人民共和国种子法》等相关法律法规，确保自己的经营活动合法合规。
严格把控包装质量：在种子包装过程中，要确保包装材料的质量符合标准，标签内容真实、准确、完整，并符合法律法规的要求。
定期自查自纠：定期对自己的经营活动进行自查自纠，及时发现并纠正存在的问题，避免违法行为的发生。
总之，种子包装不合法是一个严重的违法行为，不仅会对经营者造成经济损失，还会损害消费者的权益和市场的公平竞争。因此，我希望您能够严格遵守相关法律法规，确保自己的经营活动合法合规。如果您在经营过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时咨询相关部门或专业人士。