行政合同纠纷在大多数情况下不能通过仲裁解决，但在特定情形下可以。以下是对这一问题的详细分析：
一、行政合同通常不能通过仲裁解决
行政合同的定义与特点：
- 行政合同是行政机关为实现公共利益或行政管理目标，在法定职责范围内与公民、法人或其他组织协商订立的协议。
- 它具有显著的行政属性，合同双方当事人的法律地位不完全平等，其中一方为行政机关，享有行政优益权，如监督、指挥权及单方变更、解除合同等权力。
仲裁的适用范围：
- 仲裁主要适用于平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷。
- 由于行政合同双方主体地位的不平等性，以及行政机关所享有的特殊权力，行政合同通常不符合仲裁适用的条件。根据《中华人民共和国仲裁法》第三条的规定，依法应当由行政机关处理的行政争议不能仲裁，行政合同纠纷即属于此类。
二、特定情形下行政合同可以通过仲裁解决
尽管行政合同通常不适用仲裁，但在某些特定情形下，如果合同中涉及的争议内容属于平等主体之间的民事权利义务关系，并且双方在合同中明确约定了仲裁条款，那么就该部分争议可以按照约定申请仲裁。例如：
- 在政府与社会资本合作（PPP）项目合同中，可能会针对某些不涉及行政权力行使的事项（如工程价款结算等）约定通过仲裁方式解决纠纷。
- 在这种情况下，当事人可以依据合同中的仲裁条款向约定的仲裁机构申请仲裁。但需要注意的是，这种仲裁条款的效力需根据具体情况分析，确保不违反法律强制性规定，且争议内容确实允许当事人自由处分实体权益。
三、行政合同纠纷的其他解决途径
对于行政合同纠纷，除了可能的仲裁方式外，当事人还可以通过以下途径来解决：
行政复议：
- 向行政机关的上一级机关或法定的复议机关提出复议申请，请求对原行政行为进行审查并作出决定。
行政诉讼：
- 向人民法院提起行政诉讼，由法院对行政合同的合法性及履行情况进行审理和判决。这是解决行政合同纠纷的主要途径之一。
四、实际操作建议
明确合同性质与争议内容：
- 在签订行政合同时，应明确合同的性质及争议内容，判断是否适合约定仲裁条款。
谨慎约定仲裁条款：
- 如果确实需要约定仲裁条款，应确保争议内容属于平等主体之间的民事权利义务关系，且不违反法律强制性规定。
了解并选择合适的解决途径：
- 在发生行政合同纠纷时，应根据合同的具体内容和性质，选择合适的解决途径，如行政复议或行政诉讼。
总结来说，行政合同纠纷的解决方式需根据合同的具体内容和性质来判断。在大多数情况下，由于行政合同的行政属性和双方主体地位的不平等性，仲裁并非适用的解决方式。然而，在特定情形下（如合同中有明确的仲裁条款且争议内容属于平等主体之间的民事权利义务关系），当事人可以依据约定申请仲裁。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。