关于工厂搬迁后肥料登记证是否还有效的问题，这主要取决于工厂搬迁是否影响了其作为肥料生产企业的基本资质以及生产条件。以下是对此问题的详细解答：

首先，我们需要明确肥料登记证的有效期及其申请条件。根据相关规定，肥料登记证的有效期为5年，且申请肥料登记证的企业必须是经行政管理机关正式注册、具有法人资格的肥料生产企业，同时该企业应具备相应品种肥料产品的生产条件。

接下来，我们分析工厂搬迁对肥料登记证的影响：

1. 企业法人资格：工厂搬迁通常不会改变企业的法人资格，只要企业仍然存在且合法注册，其法人资格就保持不变。

2. 生产条件：这是关键因素。如果工厂搬迁后，其生产条件（如生产设备、质量检测设施等）仍然满足肥料登记的要求，那么理论上肥料登记证应该仍然有效。然而，如果搬迁导致生产条件发生了显著变化，例如生产设备老化、质量检测设施不足等，那么企业可能需要重新申请肥料登记证或进行相关的变更登记。

3. 登记证的有效期：无论工厂是否搬迁，肥料登记证的有效期都是固定的（5年）。如果登记证在搬迁前已经接近或超过有效期，那么企业需要在有效期内进行续展或重新申请。

建议措施：

• 检查生产条件：工厂搬迁后，企业应首先检查其生产条件是否仍然满足肥料登记的要求。
• 咨询相关部门：如果企业对生产条件是否满足要求存在疑问，可以咨询当地农业农村厅或相关管理部门，以获取更具体的指导。
• 及时办理变更或续展：如果生产条件发生了变化或登记证即将到期，企业应及时办理相关的变更登记或续展手续，以确保肥料登记证的持续有效性。

综上所述，工厂搬迁后肥料登记证是否还有效，主要取决于搬迁是否影响了企业的生产条件以及登记证的有效期。企业应密切关注这些因素，并在必要时及时采取措施以确保肥料登记证的持续有效性。