结论前置：仲裁法并非不予受理农村土地承包经营权流转合同纠纷，但具体是否受理还需根据合同中的仲裁条款以及纠纷性质来判断。
详细分析：
仲裁法的适用范围：
- 仲裁法主要规范的是仲裁协议、仲裁程序、仲裁裁决等仲裁活动的基本法律制度。它适用于平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷。
- 农村土地承包经营权流转合同，作为平等主体之间就土地承包经营权流转达成的协议，其纠纷原则上属于仲裁法的适用范围。
仲裁条款的存在：
- 关键在于农村土地承包经营权流转合同中是否包含了有效的仲裁条款。仲裁条款是双方当事人同意将争议提交仲裁解决的书面约定，是仲裁机构受理案件的前提。
- 如果合同中明确约定了仲裁条款，且该条款符合仲裁法的规定（如选定了仲裁机构、明确了仲裁事项等），那么双方因合同产生的纠纷就可以通过仲裁方式解决。
纠纷性质的影响：
- 并非所有农村土地承包经营权流转合同纠纷都适合仲裁解决。例如，如果纠纷涉及土地权属争议、土地管理法规的适用等行政法律关系，或者涉及农村集体经济组织成员资格的确认等身份关系，这些纠纷可能不属于仲裁法的调整范围，而应通过行政诉讼或民事诉讼等其他途径解决。
- 但对于纯粹的合同履行、违约责任等民事纠纷，只要合同中有有效的仲裁条款，仲裁机构通常是可以受理的。
实际操作中的注意事项：
- 在签订农村土地承包经营权流转合同时，双方应明确约定争议解决方式，包括是否选择仲裁、选定的仲裁机构等。
- 如果选择仲裁，应确保仲裁条款的合法性和有效性，避免因条款瑕疵导致仲裁机构不予受理。
- 在发生纠纷后，双方应首先审查合同中的仲裁条款，如果符合仲裁法的规定，可以向选定的仲裁机构申请仲裁。
法律建议：
- 如果您正在面临农村土地承包经营权流转合同纠纷，且合同中有有效的仲裁条款，建议您首先考虑通过仲裁方式解决纠纷。
- 如果合同中没有仲裁条款，或者仲裁条款存在瑕疵，您可以考虑与对方协商补充仲裁条款或选择其他争议解决方式（如诉讼）。
- 在处理纠纷过程中，建议您咨询专业律师的意见，以确保您的权益得到充分保障。
后续行动依据：
- 在决定是否通过仲裁解决纠纷时，您可以参考合同中的仲裁条款以及上述分析中的要点进行判断。
- 如果您需要进一步的法律帮助或咨询，可以直接向我提问，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。