针对您提出的“物业公司收取物业费的同时收取垃圾清运费由哪个部门处理”这一问题，结论如下：该问题主要涉及物业管理和垃圾清运的收费监管，通常由当地的房地产管理部门和城市管理部门（或环卫部门）共同负责处理，具体还需根据当地实际情况和政策规定来确定。
一、部门职责划分
房地产管理部门：
- 房地产管理部门（如住建局或房管局）通常负责物业管理的整体监管工作，包括物业公司的资质审核、服务标准制定、收费行为监督等。
- 如果物业公司收取的垃圾清运费被包含在物业费中，或者与物业费一同收取且存在不合理之处，房地产管理部门有权进行调查和处理。
城市管理部门（或环卫部门）：
- 城市管理部门（或环卫部门）负责城市垃圾的清运和处理工作，包括制定垃圾清运的收费标准、监督垃圾清运服务的质量等。
- 如果垃圾清运费是单独收取的，且与物业公司的服务内容无直接关联，那么城市管理部门（或环卫部门）将是主要的监管部门。
二、处理流程
投诉与举报：
- 如果您认为物业公司收取的垃圾清运费不合理或存在违规行为，可以向当地的房地产管理部门或城市管理部门（或环卫部门）进行投诉或举报。
- 投诉时，请提供详细的证据材料，如收费凭证、物业服务合同等，以便相关部门进行调查和处理。
调查与处理：
- 相关部门在接到投诉或举报后，会进行调查核实。如果确认物业公司存在违规行为，会依法进行处罚，并要求物业公司退还多收的费用。
- 同时，相关部门也会加强对物业公司的监管力度，防止类似问题再次发生。
三、特殊情况说明
- 地区差异：不同地区的物业管理政策和垃圾清运收费标准可能存在差异。因此，在处理此类问题时，需要参考当地的政策规定和实际情况。
- 合同约定：如果物业服务合同中明确约定了垃圾清运费的收取方式和标准，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么物业公司的收费行为可能是合法的。但即便如此，如果收费过高或存在其他不合理之处，业主仍有权向相关部门进行投诉或举报。
四、建议与提醒
- 了解政策：作为业主，建议您在入住前或签订物业服务合同时，详细了解当地的物业管理政策和垃圾清运收费标准，以便更好地维护自己的合法权益。
- 保留证据：在支付物业费和垃圾清运费时，请务必保留好相关的收费凭证和物业服务合同等证据材料，以备不时之需。
- 积极维权：如果您认为物业公司的收费行为存在违规之处，不要犹豫，及时向相关部门进行投诉或举报，以维护自己的合法权益。
最后，如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，欢迎随时向我咨询。