扰乱单位秩序是否会留下案底，需根据具体情节及处理结果来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 行政处罚与案底的关系：

   • 一般情况：扰乱单位秩序，如果情节较轻，未构成犯罪，通常会被公安机关依据《中华人民共和国治安管理处罚法》给予行政处罚，如警告、罚款或行政拘留。行政处罚不会留下通常意义上的“案底”，即不会在个人档案中留下犯罪记录。但行政处罚的记录会在公安机关有存档，不过这种存档一般不对外公开，仅供公安机关内部查询使用，对个人的日常生活影响较小。
   • 特殊情况：虽然行政处罚本身不构成犯罪记录，但在某些特定情况下，如涉及严重扰乱社会秩序、影响恶劣等，可能会对个人产生一定的社会评价影响，尤其是在需要政审的场合（如公务员录用、入伍等），可能会作为参考因素之一。

2. 刑事处罚与案底的关系：

   • 构成犯罪的情况：如果扰乱单位秩序的行为情节严重，构成犯罪，如聚众扰乱社会秩序罪、聚众扰乱公共场所秩序罪等，那么将会受到刑事处罚。刑事处罚会留下案底，即犯罪记录，这将对个人的未来产生深远影响，包括但不限于就业、升学、出国等方面。
   • 刑事处罚的后果：一旦留下犯罪记录，个人将面临社会的歧视和排斥，许多职业和机会将对其关闭大门。此外，犯罪记录还可能影响个人的信用评级、贷款申请等金融活动。

3. 法律建议：

   • 遵守法律法规：无论在任何情况下，都应遵守国家的法律法规，不参与任何扰乱社会秩序的行为。
   • 及时咨询律师：如果因扰乱单位秩序而受到行政处罚或面临刑事指控，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
   • 积极配合调查：在接受公安机关调查时，应积极配合，如实陈述事实，避免因为逃避或抗拒调查而加重处罚。

总结来说，扰乱单位秩序是否会留下案底，取决于行为的性质、情节以及处理结果。如果仅受到行政处罚，一般不会留下案底；但如果构成犯罪并受到刑事处罚，则会留下案底，对个人未来产生深远影响。因此，建议遵守法律法规，避免参与任何扰乱社会秩序的行为。如有任何法律问题，可直接向我咨询。