股权转让协议自始无效的法律责任主要包括财产返还、损失赔偿、恢复原状，以及可能面临的行政处罚和刑事处罚，具体责任的承担需根据双方的过错程度及实际情况综合判断。以下是对这一问题的详细分析：
一、协议无效的法律后果
自始无效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无效的股权转让协议从订立时起即不具有法律效力，不能产生当事人所期望的法律效果。这意味着，一旦协议被认定为无效，双方基于该协议所取得的权利和义务都将归于消灭。
财产恢复原状：
- 依据《民法典》第一百五十七条，民事法律行为无效后，行为人因该行为取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。在股权转让中，这通常意味着受让方需将取得的股权返还给转让方，同时转让方也需将收取的股权转让款退还给受让方。若股权已发生进一步变动，如转让给善意第三人，则可能采取折价补偿等方式处理。
赔偿损失：
- 同样根据《民法典》第一百五十七条，有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。赔偿范围包括但不限于为签订和履行协议而支付的费用、因股权无法正常使用而产生的间接损失等。例如，如果因转让方故意隐瞒重要事实导致协议无效，转让方需承担赔偿责任，退还已收取的股权转让款并支付利息，同时如因过错导致公司或其他股东受损，还需承担相应赔偿责任。
二、具体责任承担
出让方的责任：
- 若出让方故意隐瞒重要事实或提供虚假信息导致协议无效，需承担赔偿责任，退还已收取的股权转让款并支付利息。同时，如因过错导致公司或其他股东受损，还需承担相应赔偿责任。
受让方的责任：
- 受让方如明知或应知协议存在无效事由仍签订，也需承担责任。需将已取得的股权返还给出让方，并协助办理相关变更手续。若因过错导致公司或其他股东受损，同样需承担赔偿责任。
共同责任：
- 若出让方和受让方均有过错，导致协议无效并给公司或其他股东造成损失，双方应承担连带赔偿责任。
第三人的责任：
- 如股权转让协议的无效是由于第三方（如评估机构）的过错导致，该第三方也可能需承担相应的法律责任。例如，如果评估机构故意提供虚假的评估报告，导致股权转让价格严重偏离实际价值，评估机构可能需对因此造成的损失承担赔偿责任。
三、其他法律后果
行政处罚：
- 若股权转让行为违反了《中华人民共和国公司法》及相关法规的强制性规定，可能会受到行政处罚，如责令限期改正、罚款等。例如，如果股权转让未按照法定程序进行，如未经过其他股东过半数同意或未保障其他股东的优先购买权，公司登记机关可能责令转让方和受让方限期改正，并可能处以罚款。
刑事处罚：
- 如股权转让协议的无效涉及到刑事犯罪行为，如欺诈等，相关责任人可能会被追究刑事责任，依据《中华人民共和国刑法》的相关规定进行处罚。例如，如果转让方通过欺诈手段骗取受让方的股权转让款，可能构成诈骗罪，需承担刑事责任。
四、处理建议
证据收集：
- 在主张协议无效并要求承担责任时，当事人应充分收集证据以证明自己的主张，包括但不限于协议文本、转账记录、沟通记录等。这些证据将有助于证明协议无效的原因、双方的过错程度以及因此造成的损失。
诉讼时效：
- 当事人应在法律规定的诉讼时效期间内提起诉讼或申请仲裁，以免丧失胜诉权。一般来说，民事诉讼的诉讼时效期间为三年，自当事人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
法律适用：
- 在处理股权转让协议无效案件时，应确保法律的正确适用。由于股权转让涉及公司法、合同法等多个法律领域，因此需要综合考虑相关法律法规的规定，以确保判决的公正性和合法性。
总结来说，股权转让协议自始无效的法律责任是一个复杂且涉及多方面的问题。当事人在处理此类纠纷时应谨慎行事，确保自身权益得到有效保护。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。