对于没有施工许可证的在建工程，其查封方式与有证工程在法律程序上并无本质区别，但查封时需特别关注其违法性，并可能因此面临后续处理上的不同。具体来说，查封没有施工许可证的在建工程，可以从以下几个角度进行理解和操作：
查封的法律依据与程序：
- 查封在建工程，通常基于法院的判决、裁定或行政机关的行政处罚决定。对于没有施工许可证的在建工程，行政机关（如住房和城乡建设部门）在发现其违法建设后，有权依据相关法律法规（如《中华人民共和国城乡规划法》、《中华人民共和国建筑法》等）进行查处，并可能采取查封措施。
- 查封程序一般包括：立案调查、作出处罚决定、执行查封等步骤。在查封时，行政机关会出具查封决定书，并通知当事人到场，制作现场笔录，并可能邀请见证人到场见证。
查封时的特别关注点：
- 违法性认定：没有施工许可证的在建工程，本身即存在违法性。查封时，应明确记录其违法事实，如未取得施工许可证擅自施工等。
- 后续处理：查封后，行政机关会根据违法情节的轻重，决定是责令改正、罚款、拆除违法建筑还是采取其他措施。对于严重违法的在建工程，可能面临被拆除的风险。
- 当事人权益保护：在查封过程中，应确保当事人的合法权益不受侵害，如允许当事人陈述申辩、提供证据等。同时，查封措施应适度，避免对当事人造成不必要的损失。
实际操作中的建议：
- 及时沟通：如果发现没有施工许可证的在建工程，建议及时与相关部门（如住房和城乡建设部门、城市管理综合执法部门等）沟通，了解查封的具体程序和要求。
- 准备证据：在查封过程中，当事人应积极配合，并准备好相关证据（如施工合同、规划许可申请材料等），以证明自己的合法权益或减轻违法情节。
- 寻求法律帮助：如果对查封决定有异议或认为自己的权益受到侵害，可以及时寻求法律帮助，通过行政复议或行政诉讼等途径维护自己的合法权益。