在解答施工总包单位分包工程违法所得的计算问题之前，我们首先要明确，违法所得的计算通常与违法行为的性质、情节以及造成的后果紧密相关，并且需要依据具体的法律法规来进行。针对您提出的问题，我将结合相关法律法规和实际操作，给出以下详细解答：
一、违法所得的基本概念
违法所得，通常指的是因实施违法行为而获得的直接经济利益。在施工总包单位分包工程的情境中，违法所得可能包括因违法分包而获得的额外利润、管理费等。
二、违法分包行为的认定
在计算违法所得之前，必须首先确认分包行为是否违法。根据《中华人民共和国建筑法》和《建设工程质量管理条例》等相关法律法规，违法分包主要包括以下几种情形：
三、违法所得的计算方法
违法所得的计算通常涉及以下几个方面：
合同金额与实际支付金额的差额：如果违法分包合同中约定的金额高于实际支付给分包单位的金额，那么差额部分可能被视为违法所得。但这种方法需要详细审查合同和支付记录，以确定实际的经济利益流动。
额外利润或管理费：如果施工总包单位通过违法分包获得了额外的利润或管理费，这些费用也应被计入违法所得。这通常需要对施工总包单位的财务记录进行详细审查。
综合考虑因素：在计算违法所得时，还需要考虑其他可能影响计算结果的因素，如违法分包行为对工程质量、安全等方面造成的影响，以及因此产生的额外成本或损失。
四、实际操作中的注意事项
详细审查合同和财务记录：为了准确计算违法所得，必须详细审查违法分包合同以及施工总包单位的财务记录，以确定实际的经济利益流动。
考虑相关法律法规：在计算违法所得时，必须严格遵守相关法律法规的规定，确保计算方法的合法性和合理性。
咨询专业机构或律师：由于违法所得的计算可能涉及复杂的法律和财务问题，因此建议咨询专业机构或律师的意见，以确保计算结果的准确性和合法性。
五、法律后果
需要强调的是，违法分包不仅可能导致违法所得被没收，还可能面临行政处罚、民事责任甚至刑事责任。因此，施工总包单位应严格遵守相关法律法规，避免违法分包行为的发生。
综上所述，施工总包单位分包工程的违法所得计算是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多个因素。为了确保计算结果的准确性和合法性，建议咨询专业机构或律师的意见，并严格遵守相关法律法规的规定。