农村专款专用违规的处罚需根据资金性质、违规主体及行为性质综合判定，具体处罚方式如下：

1. 行政处罚

   • 违规主体：若为村集体组织或相关责任人（如村干部）挪用、截留专款，根据《中华人民共和国村民委员会组织法》第三十六条，由乡镇人民政府责令改正，对直接责任人依法给予行政处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
     
   • 资金性质：若专款属于财政拨款（如扶贫资金、农业补贴），根据《财政违法行为处罚处分条例》第六条，县级以上财政部门可责令改正，追回被挪用资金，并对单位处以挪用金额10%-30%的罚款，对责任人处以2000元-2万元罚款。
     

2. 刑事处罚

   • 挪用公款罪：若专款属于国家机关、国有企事业单位管理资金，且责任人为国家工作人员，挪用数额较大（通常5万元以上）用于营利或非法活动，或数额较大（通常10万元以上）超过3个月未还，根据《刑法》第三百八十四条，可处五年以下有期徒刑或拘役；情节严重者，处五年以上有期徒刑。
     
   • 贪污罪：若责任人通过虚报、冒领等手段非法占有专款，根据《刑法》第三百八十二条，数额较大（通常3万元以上）处三年以下有期徒刑或拘役；数额巨大（通常20万元以上）处三年以上十年以下有期徒刑；数额特别巨大（通常300万元以上）处十年以上有期徒刑、无期徒刑或死刑。
     

3. 民事责任

   • 若专款被挪用导致村民或相关主体权益受损（如项目停滞、收益损失），受害方可依据《民法典》第九百八十五条，要求责任人返还资金并赔偿损失（如利息、预期收益等）。
     

关键点提示：

• 处罚需以“专款性质明确”为前提，需通过审计、合同等证据证明资金用途限定性；
  
• 村民可通过向乡镇政府举报、申请行政复议或提起行政诉讼（针对行政处罚）维护权益；
  
• 若涉及刑事犯罪，公安机关需立案侦查，检察院提起公诉，村民可作为证人或附带民事诉讼原告参与。
  

如有具体案件细节（如资金来源、挪用方式、金额等），可进一步分析法律适用及证据收集方向。