结论：小区一楼业主在自己的小院子里沿着阳台外墙搭建玻璃雨棚是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及是否违反相关法律法规、是否侵犯他人权益以及是否符合小区管理规约等因素。以下从不同角度进行分析：
法律法规层面：
- 根据《中华人民共和国民法典》中关于相邻关系的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。如果搭建的玻璃雨棚对相邻业主的日常生活、安全或隐私等造成影响，可能构成对相邻权的侵犯。
- 同时，根据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规，任何单位和个人在城市、镇规划区内进行建筑物、构筑物、道路、管线和其他工程建设的，应当向城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府申请办理建设工程规划许可证。如果搭建的玻璃雨棚属于违法建设，即未取得建设工程规划许可证或未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，可能面临被责令限期拆除、罚款等法律后果。
小区管理规约层面：
- 小区管理规约是小区业主共同制定的，用于规范小区内业主行为的准则。如果小区管理规约中明确规定了禁止在院子内搭建构筑物或类似规定，那么业主搭建玻璃雨棚的行为就违反了小区管理规约，可能面临小区物业或业主委员会的制止和要求拆除等后果。
实际操作建议：
- 在搭建玻璃雨棚前，建议业主先咨询当地城乡规划部门或小区物业，了解相关法律法规和小区管理规约的具体要求，确保搭建行为合法合规。
- 如果搭建行为可能对相邻业主造成影响，建议事先与相邻业主进行沟通协商，取得其理解和同意，以避免不必要的纠纷。
- 如果搭建行为已经发生且存在争议，建议业主及时与相邻业主或小区物业进行沟通协商，寻求妥善解决方案。如果协商无果，可以考虑通过法律途径解决纠纷。
可能后果：
- 如果搭建的玻璃雨棚被认定为违法建设或侵犯相邻权，业主可能面临被责令限期拆除、罚款等法律后果，同时还可能承担因侵权行为给相邻业主造成的损失赔偿责任。
- 如果搭建行为违反了小区管理规约，业主可能面临小区物业或业主委员会的制止和要求拆除等后果，甚至可能影响其在小区内的声誉和权益。
总结与建议：
小区一楼业主在自己的小院子里沿着阳台外墙搭建玻璃雨棚是否合法，需综合考虑法律法规、小区管理规约以及相邻关系等因素。在搭建前，建议业主充分了解相关要求并咨询专业意见，确保搭建行为合法合规。如果遇到争议或纠纷，建议及时与相关方沟通协商或寻求法律途径解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。