结论：招标文件要求业绩应提供合同及协议，但实际仅提供合同的情况下，是否可以废标需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 从招标文件条款的严格解释角度：

   • 如果招标文件明确且具体地规定了必须同时提供合同及协议作为业绩证明，且没有提供任何例外或替代方案，那么在实际操作中，若投标人仅提供了合同而未提供协议，招标人有权依据招标文件的规定进行废标处理。这是因为招标文件是招标活动的法律依据，投标人需严格遵守其规定。

2. 从实质性响应与形式性响应的角度：

   • 在招标活动中，通常要求投标文件对招标文件作出实质性响应。如果招标文件中的业绩要求被视为实质性条款，那么投标人必须完全满足这些要求。然而，如果仅提供合同而未提供协议并未影响业绩的真实性和有效性，且招标文件未明确将此视为废标条件，那么招标人可能不宜直接废标，而应考虑其他因素，如投标人的整体实力、报价等。
   • 另一方面，如果招标文件中的业绩要求被视为形式性条款，且仅提供合同在实质上已经能够证明投标人的业绩，那么招标人可能不宜仅因形式上的不完整而废标。

3. 从公平、公正和诚实信用原则的角度：

   • 招标活动应遵循公平、公正和诚实信用的原则。如果招标人因投标人仅提供合同而废标，且这种废标行为缺乏合理的依据或解释，那么可能构成对投标人的不公平对待，违反了招标活动的原则。
   • 在这种情况下，投标人可以提出异议或投诉，要求招标人重新审查其废标决定，并可能寻求法律救济。

4. 从实际操作与风险防范的角度：

   • 对于招标人而言，为了避免因废标而引发的争议和法律风险，最好在招标文件中明确业绩证明的具体要求和废标条件，并在评标过程中严格按照招标文件的规定执行。
   • 对于投标人而言，为了确保投标文件的有效性，应仔细阅读招标文件，并严格按照其要求准备业绩证明材料。如果招标文件要求提供合同及协议，而投标人确实无法提供协议，那么可以考虑在投标文件中说明情况，并提供其他相关证明材料以支持其业绩的真实性。

建议：在实际操作中，如果招标人遇到投标人仅提供合同而未提供协议的情况，应首先审查招标文件的相关规定，并考虑业绩要求的实质性和形式性。如果招标文件未明确将此视为废标条件，且仅提供合同在实质上已经能够证明投标人的业绩，那么招标人可以考虑不废标，而是继续评估投标人的其他方面。当然，如果招标人认为有必要废标，也应确保废标决定有合理的依据和解释，并遵循公平、公正和诚实信用的原则。

后续行动：如果您作为招标人或投标人遇到了此类问题，且对如何处理存在疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。