结论：当查封的被告人房产已经抵押给银行时，处理方式需根据具体情况来定，但通常涉及与银行的协商、参与分配程序以及可能的法律救济途径。
详细分析：
与银行协商：
- 情况说明：首先，需要明确的是，房产抵押给银行后，银行在抵押权范围内对该房产享有优先受偿权。因此，在房产被查封的情况下，应首先与银行进行沟通，了解银行对于该房产的处置意愿和条件。
- 协商内容：可以尝试与银行协商，看是否能够通过还款、转贷或其他方式解除抵押，以便房产能够更灵活地处理。如果银行同意，这将是解决查封问题的一个有效途径。
参与分配程序：
- 法律背景：如果房产无法解除抵押，且被告人的其他财产不足以清偿债务，那么债权人（包括查封房产的债权人）可能需要通过参与分配程序来按比例受偿。
- 程序要点：参与分配程序通常需要在法院的主持下进行，债权人需要提交相关证据证明自己的债权，并按照法院确定的分配方案受偿。在这个过程中，银行的抵押权将得到优先保障，剩余部分才会按照债权比例分配给其他债权人。
法律救济途径：
- 异议之诉：如果认为查封行为存在错误或违法，或者对银行的抵押权有异议，可以通过提起异议之诉来寻求法律救济。这需要提供充分的证据来证明自己的主张，并经过法院的审理和判决。
- 其他法律手段：根据具体情况，还可以考虑其他法律手段，如申请复议、提出执行异议等，以维护自己的合法权益。
建议与注意事项：
- 及时行动：在发现房产被查封且已抵押给银行后，应尽快采取行动，与银行和相关法院进行沟通，了解具体情况并寻求解决方案。
- 保留证据：在整个过程中，应妥善保留所有相关证据，包括房产证、抵押合同、查封裁定等，以便在需要时提供证明。
- 咨询专业律师：虽然这里已经提供了一些基本的法律分析和建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在处理此类复杂问题时，建议咨询专业律师以获取更具体、更专业的法律意见。
可能后果：
- 如果无法与银行达成协议，且其他债权人众多，那么通过参与分配程序受偿的金额可能会相对较少。
- 如果提起异议之诉或其他法律手段，需要承担一定的诉讼风险和成本，包括时间、金钱和精力等。因此，在决定采取这些措施前，应充分评估其可行性和必要性。
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