结论概述：

1. 若分期还款协商中明确约定了只还本金，且后续一次性还清本金时未产生新的费用或利息，则多出的部分一般不需要还。
2. 若协商过程中存在模糊条款或后续产生了新的费用（如逾期利息、违约金等），则可能需要根据实际情况进行偿还。

详细分析：

首先，我们需要明确分期还款协商的法律性质。这种协商通常是借款人和贷款人之间就借款的偿还方式、期限、利率等条款进行的重新约定，具有合同性质。因此，协商的内容应当明确、具体，且双方应当遵循诚实信用原则履行各自的义务。

1. 协商中明确约定只还本金的情况：

   • 如果在协商过程中，双方明确约定了借款人只需偿还本金，且没有约定其他任何费用或利息，那么借款人在按照约定偿还了一半本金后，后续一次性还清剩余本金时，一般不需要再偿还多出的部分。
   • 这种情况下，协商的条款对双方都具有约束力，借款人只需按照约定履行还款义务即可。

2. 协商中存在模糊条款或后续产生新费用的情况：

   • 如果在协商过程中，条款存在模糊或不明确的地方，或者双方没有就某些费用（如逾期利息、违约金等）进行明确约定，那么在后续一次性还清本金时，可能会产生争议。
   • 例如，如果协商中只约定了“只还本金”，但没有明确是否包括逾期利息或违约金，那么在借款人逾期还款的情况下，贷款人可能会要求借款人支付逾期利息或违约金。
   • 此外，如果协商后双方又产生了新的费用或利息（如因借款人逾期还款而产生的罚息），那么借款人可能需要根据实际情况进行偿还。

法律建议：

• 审查协商条款：借款人应仔细审查分期还款协商的条款，确保条款明确、具体，且没有遗漏任何重要信息。
• 保留证据：借款人应保留好与贷款人的协商记录、还款凭证等证据，以备不时之需。
• 及时沟通：如果借款人在还款过程中遇到任何问题或困难，应及时与贷款人沟通，寻求解决方案。
• 咨询专业律师：如果借款人对协商条款或还款义务存在疑问或争议，可以咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。

可能法律后果：

• 如果借款人未按照协商约定履行还款义务，贷款人可能会采取法律手段追讨欠款，包括但不限于起诉、申请强制执行等。
• 如果借款人在协商过程中存在欺诈、胁迫等违法行为，贷款人还可以要求撤销协商协议，并追究借款人的法律责任。

总之，分期还款协商只还本金的情况下，后续一次性还清本金时是否需要偿还多出的部分，取决于协商条款的具体内容和实际情况。借款人应仔细审查协商条款，保留好相关证据，并在必要时咨询专业律师。