在水利工程中，若遇到不利物质条件，承包人通常可以索赔的费用和损失主要包括以下几个方面：
工期延长索赔：
- 法律依据：根据《民法典》及相关建设工程合同条款，因不利物质条件导致工程无法按原定计划进行，承包人有权要求工期相应延长。
- 具体情形：例如，施工中遇到未预见的地质条件（如软土层、岩层断裂等），导致挖掘、打桩等作业难度增加，进度受阻。
- 索赔内容：承包人可以提交工期延长申请，附上地质勘察报告、施工日志等证据，要求发包人批准延长工期，以避免因工期延误而承担违约责任。
费用增加索赔：
- 法律依据：同样基于《民法典》及合同条款，不利物质条件可能导致承包人额外支出费用，如增加的挖掘费用、特殊材料费用、设备租赁费用等。
- 具体情形：如遇到地下水位异常升高，需要增加排水设备或采取降水措施，从而产生额外费用。
- 索赔内容：承包人应详细记录额外费用的发生情况，包括费用明细、发票、合同等证明材料，向发包人提出费用增加索赔。
利润损失索赔：
- 法律依据：在不利物质条件导致工程成本大幅增加，且合同未明确约定风险分担方式的情况下，承包人可能有权要求补偿部分利润损失。
- 具体情形：例如，因不利物质条件导致工程变更，原定的施工方案无法实施，需要采用更昂贵的方案，从而影响了承包人的预期利润。
- 索赔内容：承包人需提供充分的证据证明利润损失的存在及金额，如原合同预算、变更后的预算、利润计算依据等，向发包人提出利润损失索赔。但需注意，此类索赔的成功率可能因合同条款、法律规定及具体案情而异。
其他相关损失索赔：
- 法律依据：根据《民法典》中关于侵权责任或合同违约责任的规定，不利物质条件若因发包人提供的设计文件、地质勘察报告等存在错误或遗漏导致，承包人还有权要求发包人赔偿因此造成的其他相关损失。
- 具体情形：如因发包人提供的地质勘察报告不准确，导致承包人未能预见不利物质条件，从而遭受损失。
- 索赔内容：承包人应收集相关证据，如设计文件、地质勘察报告、施工过程中的照片、视频等，证明损失与发包人提供的资料错误或遗漏之间的因果关系，向发包人提出其他相关损失索赔。
在提出索赔时，承包人应注意以下几点：
- 及时通知：一旦发现不利物质条件，承包人应立即通知发包人，并说明可能对工程造成的影响。
- 详细记录：承包人应详细记录不利物质条件的发生情况、对工程的影响、已采取的措施及效果等，为索赔提供充分证据。
- 合理索赔：承包人提出的索赔应合理、合法，且符合合同条款及法律规定，避免过度索赔或无理索赔。
- 协商解决：在可能的情况下，承包人应与发包人协商解决索赔问题，以达成双方都能接受的解决方案。
若协商无果，承包人还可以考虑通过法律途径解决索赔争议，如向法院提起诉讼或申请仲裁等。在处理此类问题时，建议承包人咨询专业律师，以确保自身权益得到充分保障。