信托基金如果是违法所得，确实存在被没收的可能性，但具体是否会被没收需根据实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、法律背景与原则

根据我国相关法律规定，违法所得是指因违反法律、法规、规章而获得的利益。对于违法所得，法律通常规定应当予以没收，以维护法律的尊严和社会的公平正义。信托基金作为一种财产管理方式，如果其资金来源或运作方式违反了法律、法规，那么该信托基金就可能被视为违法所得。

二、没收违法所得的法律依据

1. 《中华人民共和国刑法》：该法规定了对于犯罪所得及其产生的收益应当予以追缴或者责令退赔。如果信托基金与犯罪活动有关，如涉及洗钱、诈骗等犯罪行为，那么该信托基金就可能被依法追缴或没收。
2. 《中华人民共和国信托法》：虽然该法主要规范信托关系，但如果信托的设立、运作或终止过程中存在违法行为，如违反信托目的、损害受益人利益等，相关违法所得也可能面临被没收的法律后果。不过，这种情况下通常需要先通过法律程序确认信托的违法性，再决定是否没收。
3. 其他相关法律法规：如《中华人民共和国反洗钱法》等，也可能对涉及违法所得的信托基金产生约束和影响。

三、没收违法所得的实践操作

1. 调查与取证：在决定是否没收信托基金之前，相关部门（如公安机关、检察机关、法院等）会进行深入的调查和取证工作，以确认信托基金是否确实为违法所得。
2. 法律程序：如果确认信托基金为违法所得，相关部门会依法启动没收程序。这通常包括发出没收通知书、举行听证会（如果当事人要求）、作出没收决定等步骤。
3. 执行与监督：没收决定作出后，相关部门会负责执行没收工作，并接受社会监督以确保执行的公正性和合法性。

四、特殊情况与例外

1. 信托基金的合法性：如果信托基金的设立、运作和终止都符合法律法规的规定，且没有涉及任何违法行为，那么该信托基金就不会被没收。
2. 善意取得与保护：在某些情况下，如果信托基金的受益人或受托人能够证明其是善意取得该信托基金的，且没有参与任何违法行为，那么其合法权益可能会得到一定程度的保护。不过，这需要根据具体情况和法律规定来判断。

五、法律建议

1. 合规运作：为了避免信托基金被没收的风险，建议信托的设立人、受托人和受益人都要严格遵守法律法规的规定，确保信托的合法性和合规性。
2. 及时咨询：如果对信托基金的合法性或运作方式存在疑问，建议及时咨询专业律师或相关机构以获取准确的法律意见和指导。

总结来说，信托基金如果是违法所得，确实存在被没收的可能性。但具体是否会被没收需根据信托基金的实际情况、相关法律法规的规定以及法律程序的执行情况来判断。如果你对信托基金的合法性或运作方式有疑问，可以直接向我咨询。