办理因人体器官功能丧失而申领残疾人证的鉴定及立案，主要由县级残联负责组织，并委托指定的医疗鉴定机构进行医学鉴定。具体流程和负责部门如下：

1. 申请与受理：
   申请人（或其监护人）需向户籍所在地的县级残疾人联合会（残联）提出办证申请，并提交相关材料（如身份证明、病历资料等）。残联负责受理申请，并告知申请人鉴定流程。

2. 医学鉴定：
   县级残联会委托指定的医疗鉴定机构（如医院、专科诊疗中心等）对申请人的器官功能丧失程度进行医学鉴定。鉴定机构需具备相应资质，并按照《残疾人残疾分类和分级》国家标准（GB/T 26341-2010）出具鉴定结论。

3. 审核与发证：
   县级残联根据鉴定结论，审核申请人是否符合残疾标准。若符合，将发放《中华人民共和国残疾人证》；若不符合，会书面说明理由。

关键点说明：

• 部门分工：残联是组织协调部门，医学鉴定由专业机构完成，两者共同构成办证的核心流程。
  
• 鉴定标准：器官功能丧失需达到国家规定的残疾等级（如视力、听力、肢体、智力、精神等类别中的相应级别）。
  
• 跨地区申请：若户籍地与居住地不一致，可向居住地县级残联提出申请，由其协助联系户籍地残联办理。

建议：

• 提前联系当地残联确认指定鉴定机构名单及所需材料清单，避免因材料不全延误办理。
  
• 若对鉴定结论有异议，可向残联申请重新鉴定或通过法律途径维权。
  

如有进一步疑问（如具体流程、材料要求或异议处理），可直接向我咨询，我会结合您所在地区的政策细节为您详细解答。