结论：司机撞高速护栏后逃逸，赔偿200万是否与车主有关，需根据具体情况判断，主要包括司机与车主的关系、车主是否存在过错等因素。以下从不同角度进行分析：

1. 司机与车主的关系

   • 雇佣关系：如果司机是车主的雇员，且在执行工作任务过程中发生事故并逃逸，根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条：“用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。用人单位承担侵权责任后，可以向有故意或者重大过失的工作人员追偿。”在此情况下，车主（用人单位）可能需要先承担赔偿责任，之后可向司机追偿。但赔偿200万是否合理，需根据实际损失、保险情况等因素综合判断。
   • 非雇佣关系：如果司机与车主之间不存在雇佣关系，如司机是借用、租用或擅自使用车主车辆，那么车主在无过错的情况下，一般不承担赔偿责任。赔偿200万的责任应由司机自行承担。

2. 车主是否存在过错

   • 车辆管理过错：如果车主对车辆管理存在过错，如未妥善保管车钥匙、未对车辆进行必要的安全检查等，导致司机能够轻易获取车辆并发生事故，车主可能需要承担一定的赔偿责任。但具体责任比例需根据过错程度、事故原因等因素由法院判定。
   • 无过错情况：如果车主对事故的发生无任何过错，如车辆被盗用、司机擅自驾驶等，车主一般不承担赔偿责任。赔偿200万的责任应完全由司机承担。

3. 保险情况

   • 交强险与商业险：如果车辆购买了交强险和商业险，保险公司应在保险范围内承担赔偿责任。但逃逸行为可能影响保险公司的赔付，具体需根据保险合同条款和法律规定判断。如果保险公司拒赔或赔付不足，剩余部分需由司机或车主（根据上述关系）承担。
   • 保险免赔：部分保险合同中可能约定逃逸行为为免赔事由，此时保险公司可能不承担赔偿责任，全部损失需由司机或车主承担。

4. 法律后果与建议

   • 法律后果：司机逃逸行为可能面临行政处罚（如罚款、拘留、吊销驾驶证等）和刑事责任（如交通肇事罪）。同时，逃逸行为可能影响民事赔偿责任的承担，如保险公司拒赔、加重赔偿责任等。
   • 建议：对于车主而言，应妥善保管车辆，避免车辆被非法使用；对于司机而言，应遵守交通法规，发生事故后应及时报警、保护现场、救助伤者，避免逃逸行为带来的严重后果。如果涉及赔偿问题，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。

总结：司机撞高速护栏后逃逸，赔偿200万是否与车主有关，需根据司机与车主的关系、车主是否存在过错、保险情况等因素综合判断。建议车主和司机在面对此类问题时，及时咨询专业律师，以便更好地了解自身权利和义务，避免不必要的法律风险。