商贸有限公司可以代持隐形股东股份，但这种行为存在较大的法律风险和合规问题，不建议采用。以下从多个角度进行分析：
一、法律层面分析
代持协议的效力：
- 代持协议，即实际出资人与名义股东之间签订的协议，约定由名义股东代为持有股份。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，只要代持协议是双方真实意思表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，该协议在双方之间是有效的。
- 然而，代持协议的效力并不等同于其对外效力的完全保障。当涉及第三人利益时，如公司债权人、其他股东等，代持协议可能无法对抗善意第三人。
公司法的限制：
- 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司应当将股东的姓名或者名称向公司登记机关登记；登记事项发生变更的，应当办理变更登记。未经登记或者变更登记的，不得对抗第三人。
- 这意味着，如果商贸有限公司代持隐形股东股份，且未在公司登记机关进行登记或变更登记，那么这种代持行为在公司外部可能无法产生法律效力，隐形股东的权利可能无法得到充分保障。
税务和合规风险：
- 代持股份可能涉及税务问题，如股权转让的税务处理、分红所得的税务申报等。如果处理不当，可能面临税务处罚。
- 此外，代持行为还可能违反公司章程、股东协议或相关监管规定，导致合规风险。
二、实际操作层面分析
公司治理结构的影响：
- 代持隐形股东股份可能破坏公司的治理结构，影响公司的决策效率和稳定性。因为隐形股东不直接参与公司管理，其意见和利益可能无法得到充分表达和保障。
股东权益的保障：
- 隐形股东由于未在公司登记机关登记，其股东权益可能受到侵害。例如，在分红、股权转让、公司解散等情况下，隐形股东的权利可能无法得到充分保障。
法律纠纷的风险：
- 代持行为可能引发法律纠纷，如名义股东与实际出资人之间的纠纷、公司与其他股东或债权人之间的纠纷等。这些纠纷可能涉及复杂的法律问题，处理起来耗时耗力。
三、建议与风险提示
避免代持行为：
- 鉴于代持行为存在的法律风险和合规问题，建议商贸有限公司避免采用代持方式持有股份。如果确实需要隐藏股东身份，可以考虑通过其他合法方式实现，如设立信托、使用 nominee 结构（但需注意合规性）等。
完善公司治理结构：
- 如果公司确实存在需要隐藏股东身份的情况，应完善公司治理结构，确保所有股东的权利得到充分保障。例如，可以制定详细的股东协议，明确各股东的权利和义务。
咨询专业律师：
- 在涉及股份代持等复杂法律问题时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案，帮助公司规避法律风险。
综上所述，商贸有限公司代持隐形股东股份虽然在一定程度上可能实现隐藏股东身份的目的，但存在较大的法律风险和合规问题。因此，不建议采用这种方式。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。