结论：纪检打电话通知自行去留置中心，这一行为本身并不直接等同于违法，但具体是否合法需结合通知的内容、方式以及留置措施的合法性来综合判断。
分析说明：
通知行为的性质：
- 纪检部门作为党内监督机构，有权对涉嫌违纪违法的党员干部进行调查。在调查过程中，纪检部门可能会要求相关人员配合调查，这包括通知其到指定地点接受询问或留置。
- 打电话通知自行去留置中心，可以视为纪检部门在行使调查权时的一种通知方式。这种通知方式本身并不违法，但关键在于通知的内容是否明确、合法，以及是否遵循了相应的程序。
留置措施的合法性：
- 留置是纪检部门在调查涉嫌严重违纪违法案件时，对被调查人采取的一项限制人身自由的措施。根据相关规定，留置措施必须严格依法进行，包括留置的对象、条件、程序等都必须符合法律要求。
- 如果纪检部门在通知自行去留置中心时，已经依法作出了留置决定，并且通知中明确告知了留置的原因、期限等关键信息，那么这一行为是合法的。
- 反之，如果纪检部门未依法作出留置决定，或者通知中未明确告知留置的相关信息，甚至以威胁、欺骗等方式要求被调查人自行去留置中心，那么这一行为就可能涉嫌违法。
被调查人的权利：
- 被调查人在接到纪检部门的通知后，有权了解通知的具体内容，包括是否涉及留置措施、留置的原因和期限等。
- 如果被调查人对通知内容有疑问或异议，有权向纪检部门提出询问或申诉。同时，被调查人也有权委托律师或亲友协助处理相关事宜。
法律建议：
对于被调查人：
- 在接到纪检部门的通知后，应保持冷静，仔细了解通知的具体内容。
- 如果通知涉及留置措施，应要求纪检部门出示相关的留置决定书或通知文件，并仔细阅读其中的条款。
- 如有疑问或异议，应及时向纪检部门提出询问或申诉，并考虑委托律师或亲友协助处理。
对于纪检部门：
- 在通知被调查人自行去留置中心时，应确保通知内容明确、合法，并遵循相应的程序。
- 应依法作出留置决定，并明确告知被调查人留置的原因、期限等关键信息。
- 应尊重被调查人的权利，保障其合法权益不受侵犯。
可能后果：
- 如果纪检部门的通知行为合法且合规，被调查人应配合调查，否则可能面临更严重的法律后果。
- 如果纪检部门的通知行为违法或违规，被调查人有权提出异议或申诉，并可能因此避免不必要的留置或减轻留置的期限。同时，纪检部门也可能因此承担相应的法律责任。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。