驾驶无牌照机动电动三轮车发生事故并被认定次要责任时，驾驶者将面临行政处罚和民事赔偿的双重责任。以下是对此问题的详细分析：
一、行政处罚
无牌上路处罚：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，未悬挂机动车号牌上路的，公安机关交通管理部门可以扣留机动车，并处警告或者二十元以上二百元以下罚款。由于您驾驶的是无牌照机动电动三轮车，这一处罚将直接适用。
无证驾驶处罚（如适用）：
- 如果您没有机动车驾驶证而驾驶此类电动三轮车，还将面临无证驾驶的处罚。根据法律规定，无证驾驶可处二百元以上二千元以下罚款，并可并处15日以下拘留。
事故责任加重处罚：
- 虽然无牌无证上路本身不直接决定事故责任划分，但会加重违法方的处罚。即使您在事故中责任较小，也会因无牌无证而面临更严厉的行政处罚。
二、民事赔偿
责任比例承担：
- 根据交通事故责任认定书，您需要按照次要责任的比例承担相应的民事赔偿责任。这包括赔偿对方因事故造成的医疗费、护理费、交通费等合理费用。
赔偿范围与标准：
- 赔偿范围通常包括直接经济损失和间接经济损失。直接经济损失如车辆维修费、医疗费等；间接经济损失如误工费、护理费等。赔偿标准将依据相关法律法规和当地司法实践进行确定。
三、特殊情形与加重处罚
逃逸行为：
- 如果事故发生后您选择逃逸，将承担全部责任。同时，尚不构成犯罪的，将处二百元以上二千元以下罚款，并可并处15日以下拘留；构成犯罪的，将依法追究刑事责任，且终生不得重新取得机动车驾驶证。
驾照扣分（如适用）：
- 如果您有机动车驾驶证但驾驶无牌超标电瓶车，您的驾照可能会被扣12分，并面临相应的处罚。
四、建议与措施
立即停车并保护现场：
- 事故发生后，应立即停车并保护现场，以便后续的事故认定和责任划分。
抢救伤者并报警：
- 如有人员受伤，应立即采取急救措施，并迅速送往医院救治。同时，拨打122报警电话，向交警部门报告事故情况。
配合调查并收集证据：
- 配合交警部门的调查工作，如实陈述事故经过，提供相关证据和信息。在等待交警的过程中，可拍摄现场照片、记录证人证言等，以备后续责任认定使用。
协商赔偿或寻求法律援助：
- 根据事故责任划分结果，双方可协商赔偿事宜。若协商不成，可通过法律途径解决争议。在此过程中，如有需要，可寻求专业律师的法律援助。
总结：驾驶无牌照机动电动三轮车发生事故并被认定次要责任时，您将面临行政处罚和民事赔偿的双重责任。为了维护自身和他人的安全，请务必遵守交通规则，确保车辆合法上牌，并在事故发生后积极配合调查和处理工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。