针对您提出的问题，即大货车行驶证已过户但营运证未过户，如果此时进行运营会如何处罚，以下是我为您提供的详细解答：
一、明确法律后果
当大货车的行驶证已经过户，但营运证尚未过户时，车辆实际上并不具备合法的营运资格。根据《道路运输条例》的相关规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的，将面临严厉的处罚。具体来说，这种行为属于非法营运，一旦被发现，将会受到交通管理部门的查处。
二、可能的处罚措施
罚款：根据违法情节的严重程度，交通管理部门有权对非法营运的大货车处以罚款。罚款的金额可能因地区和具体违法情况而有所不同，但通常都会是一个相对较大的数额，以起到惩戒作用。
扣留车辆：在查处非法营运行为时，交通管理部门有权扣留涉事车辆，直至车主或运营者完成相关手续的补办或接受处罚。
其他处罚：除了罚款和扣留车辆外，交通管理部门还可能根据具体情况对车主或运营者采取其他处罚措施，如吊销驾驶证、暂扣营运证（如果已存在但未过户）等。
三、建议处理流程
为了避免上述处罚，并确保大货车的合法营运，我建议您采取以下步骤：
立即停止运营：在营运证未过户之前，应立即停止大货车的运营活动，以避免进一步的法律风险。
补办营运证过户手续：尽快与原车主或相关管理部门联系，了解并完成营运证的过户手续。这通常需要提供一系列相关证件和材料，如车辆行驶证、驾驶证、从业资格证、身份证以及原营运证等。
咨询当地交通管理部门：由于不同地区的具体政策和要求可能存在差异，我建议您在补办过户手续前，先咨询当地交通管理部门，了解详细的办理要求和流程。
确保合规运营：在完成营运证过户手续后，务必确保大货车的所有证件和手续都齐全且有效，以合规的方式进行运营活动。
综上所述，大货车行驶证已过户但营运证未过户时进行运营是违法的，并可能面临严重的处罚。因此，我强烈建议您立即停止运营，并尽快完成营运证的过户手续，以确保车辆的合法营运。