结论：是否需要继续保留履约保函，需结合合同约定、工程实际进展及双方协商情况综合判断，具体分析如下：

1. 合同约定优先
   若施工合同中明确约定“工程竣工验收合格后保函失效”或“基本完成施工后保函可退还”，则应按合同条款执行。此时，即使工程未完全竣工，只要达到合同约定的“基本完成”标准（如主体结构完工、主要设备安装完毕等），发包方应退还保函或允许其失效。
   建议：立即核查合同中关于保函退还条件、期限及“基本完成施工”定义的条款，这是判断是否需继续保留保函的核心依据。

2. 工程实际进展与风险评估
   若合同未明确约定，需评估工程“基本完成”后的剩余风险：

   • 剩余工程量：若仅剩少量收尾工作（如装修、调试），且承包方已提交竣工验收申请，风险较低，可协商退还保函；
     
   • 潜在风险：若存在质量缺陷、未完工程可能导致发包方损失（如返工费用、工期延误赔偿），发包方可能要求继续保留保函作为担保。
     建议：与发包方沟通，明确剩余工程量及风险点，提供书面证明（如监理报告、进度确认单）支持保函退还请求。

3. 双方协商与行业惯例
   即使合同无明确约定，双方仍可协商调整保函期限。实践中，若工程已通过阶段性验收（如主体结构验收），且承包方信誉良好，发包方可能同意退还部分保函或替换为质量保证金。
   建议：主动与发包方协商，提出替代方案（如缩短保函有效期、降低保函金额），平衡双方利益。

4. 法律风险防范
   若发包方无正当理由拒绝退还保函，承包方可依据《民法典》第577条（违约责任）主张权利，但需证明已完全履行合同义务且无违约行为。
   建议：保留工程进度证明、验收文件等证据，避免因保函长期占用资金导致损失。

总结：是否继续保留履约保函需以合同约定为基础，结合工程实际风险和双方协商结果确定。建议优先核查合同条款，再与发包方沟通，必要时通过法律途径维护权益。如有具体合同条款或工程细节需进一步分析，可直接向我咨询。