监管部门对银行15万贷款档案存在瑕疵的处理方式，需结合瑕疵类型、严重程度及是否造成实际损失综合判断，具体处理方式如下：
要求限期整改
若档案瑕疵属于程序性疏漏（如材料缺失、签字不规范、日期错误等），但未导致贷款风险实质性上升，监管部门通常会向银行下发《整改通知书》，要求其在15-30个工作日内补充完善材料、修正错误，并提交书面整改报告。例如，若借款人收入证明缺失但银行已通过其他方式核实还款能力，监管部门可能仅要求补交材料。
行政处罚（视情节轻重）
若瑕疵涉及关键信息隐瞒、虚假记载或违规操作（如虚构贷款用途、未核实借款人资质），监管部门可能依据《银行业监督管理法》第46-48条，对银行处以20万-50万元罚款，并对直接责任人给予警告或罚款。例如，若银行未留存借款人婚姻状况证明导致贷款用途失控，可能被认定为“未严格审查贷款资料”。
风险警示或约谈高管
若档案瑕疵反映银行内控存在系统性漏洞（如多笔贷款档案同时出现同类问题），监管部门可能对银行采取风险警示措施，或约谈分管行长、风控部门负责人，要求其提交内控整改方案，并可能降低银行监管评级，影响其后续业务开展。
追究刑事责任（极端情况）
若档案瑕疵与贷款诈骗、违法发放贷款罪等刑事犯罪相关（如银行员工与借款人串通伪造材料），监管部门会将线索移交公安机关，银行相关责任人可能面临5年以下有期徒刑或拘役（刑法第186条）。例如，若银行员工明知借款人提供虚假合同仍发放贷款，可能构成共犯。
对借款人的影响：
若档案瑕疵未影响贷款合同效力（如利率、期限等核心条款合法），借款人仍需按约还款；但若瑕疵导致合同无效（如贷款用途违法），借款人可能只需返还本金，无需支付利息。若银行因瑕疵被处罚，借款人可向监管部门投诉，要求银行纠正违规行为。
建议：
若您是借款人，发现贷款档案存在瑕疵，可要求银行补充材料或更正记录；若银行拒绝，可向当地银保监局举报。若您是银行工作人员，建议立即自查同类贷款档案，主动整改以避免监管处罚。如有具体案例细节，可进一步向我咨询。