建工合同的计价方式选择（按清单计价或按图纸计价）需根据合同约定、项目特性及法律规定综合判断，具体分析如下：

1. 合同约定优先
   若合同中明确约定了计价方式（如“按工程量清单计价”或“按施工图纸及定额计价”），则双方应严格按合同执行。

   • 清单计价：适用于招标阶段已明确工程量清单的项目，合同价款基于清单项目综合单价计算，结算时按实际完成工程量调整（如《建设工程工程量清单计价规范》GB50500-2013）。
     
   • 图纸计价：适用于设计深度不足、需通过施工图细化工程量的项目，合同价款通常按定额或市场价结合图纸计算，结算时可能涉及设计变更调整。
     关键点：若合同条款存在歧义（如同时提及清单和图纸但未明确优先级），需结合合同目的、行业惯例及双方交易习惯解释，必要时通过补充协议明确。

2. 设计变更与计价方式冲突的处理
   若施工过程中发生设计变更，导致原计价方式无法适用（如清单项目缺失或图纸工程量与清单严重不符），双方应协商调整计价方式：

   • 清单计价项目：变更部分可参照类似清单项目单价或重新组价，需符合合同约定的调价规则（如材料价差调整、措施费计算等）。
     
   • 图纸计价项目：变更部分通常按实际发生的工程量重新计算，需留存签证、变更通知等证据。
     风险提示：若未及时办理变更手续，可能引发结算争议，建议变更发生后14日内书面确认。

3. 法律强制性规定的影响

   • 必须招标项目：若项目属于依法必须招标的范围，且招标文件明确要求采用清单计价，则合同不得违背该约定（《招标投标法》第46条）。
     
   • 政府投资项目：部分地区规定政府投资项目必须采用清单计价（如《政府投资条例》），此时图纸计价可能被认定为无效条款。
     建议：签订合同前核查项目性质及地方性法规，避免计价方式违法导致合同条款无效。

4. 实务中的混合计价模式
   部分项目可能采用“清单+图纸”混合计价（如主体结构按清单计价，装饰装修按图纸计价），此时需在合同中明确分界点及计价规则，避免结算时重叠或遗漏。
   示例：合同可约定“基础工程按清单计价，二次结构按图纸实际工程量结算”，并附分部分项工程量清单与图纸对应表。

总结建议：

• 签订合同前，根据项目特点（如设计深度、工期、变更可能性）选择计价方式，并在合同中明确约定计价依据、调价规则及争议解决方式。
  
• 施工过程中，及时办理设计变更、签证等手续，保留书面证据。
  
• 结算阶段，若对计价方式有争议，可委托第三方造价机构审核，或通过诉讼/仲裁解决。
  

如有具体合同条款或项目情况需分析，可进一步提供细节，我将为您详细解答。