结论：朋友做完医美两年后觉得花钱多了，能否起诉医院，这取决于多个因素，包括是否存在欺诈、合同违约或医疗过错等情形，以及是否已过诉讼时效。以下从不同角度进行分析：
一、诉讼时效角度
一般诉讼时效：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，如果朋友在医美服务后两年内发现权益受损，且未超过三年的诉讼时效期间，理论上是可以起诉的。但需注意，诉讼时效的起算点可能因具体情况而异，如从知道或应当知道权益受损之日起计算。
特殊情况：如果朋友在医美服务后很长时间才发现问题，或者医院存在故意隐瞒、欺诈等行为，导致朋友未能及时知晓权益受损，诉讼时效的起算点可能会相应推迟。然而，这需要具体证据支持，且法院会根据实际情况进行判断。
二、法律关系角度
合同关系：医美服务通常基于合同关系进行。如果朋友认为医院在提供服务过程中存在违约行为，如未按照约定提供服务、服务存在瑕疵等，且因此造成了经济损失，可以根据合同法的相关规定起诉医院，要求赔偿损失。但需注意，合同违约的举证责任在朋友一方，需要提供充分的证据证明医院存在违约行为。
侵权关系：如果朋友认为医院在提供医美服务过程中存在过错，如操作不当导致身体受损、使用不合格产品等，且因此造成了经济损失或身体伤害，可以根据侵权责任法的相关规定起诉医院，要求赔偿损失。同样，侵权关系的举证责任也在朋友一方，需要提供充分的证据证明医院存在过错。
欺诈行为：如果朋友认为医院在提供医美服务过程中存在欺诈行为，如虚构服务效果、隐瞒真实情况等，导致朋友在不知情的情况下支付了高额费用，可以根据消费者权益保护法的相关规定起诉医院，要求退还费用并赔偿损失。欺诈行为的举证责任同样在朋友一方。
三、实际操作建议
收集证据：如果朋友决定起诉医院，首先需要收集充分的证据来支持自己的主张。这包括但不限于医美服务合同、付款凭证、医院宣传资料、服务过程中的照片或视频、医疗记录等。
咨询专业律师：由于医疗纠纷和医疗事故赔偿领域涉及复杂的法律问题和专业知识，建议朋友在起诉前咨询专业律师，如我宋中清律师，以获取更具体的法律建议和指导。
考虑和解或调解：在起诉前，朋友也可以考虑与医院进行和解或调解，以达成双方都能接受的解决方案。这不仅可以节省时间和精力，还可以避免不必要的法律纠纷。
总结：朋友做完医美两年后觉得花钱多了，能否起诉医院取决于多个因素。如果朋友认为医院存在欺诈、合同违约或医疗过错等情形，且未超过诉讼时效期间，理论上是可以起诉的。但具体能否成功起诉并获得赔偿，还需要根据实际情况和证据进行判断。因此，建议朋友在决定起诉前咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。