使用笔名发表作品时，权利的确定主要依据《中华人民共和国著作权法》的相关规定，核心在于证明作者身份与作品的对应关系。 以下是具体分析：

1. 著作权归属的法定原则
   根据《著作权法》第十一条，著作权自作品创作完成之日起自动产生，无论是否使用真实姓名或笔名，作者均依法享有著作权。因此，使用笔名发表作品不影响著作权的原始归属，权利仍属于创作该作品的自然人、法人或非法人组织。

2. 笔名使用下的权利证明要点
   由于笔名具有匿名性，实践中需通过证据链证明作者身份与作品的对应关系，常见方式包括：

   • 创作过程证据：如手稿、创作笔记、电子文档的修改记录、时间戳等，证明作品由特定主体独立完成；
     
   • 发表记录：作品首次发表的载体（如期刊、网站、社交媒体）中标注的笔名信息，需与作者身份关联；
     
   • 第三方证言：合作方、编辑、同行等知情人的书面证言，确认笔名与真实作者的对应关系；
     
   • 公开声明或备案：作者曾通过公开渠道（如个人网站、媒体采访）声明笔名与作品的关联，或向版权登记机构备案笔名信息。

3. 版权登记的辅助作用
   虽然著作权无需登记即可成立，但自愿登记可强化权利证明效力。若使用笔名，建议在登记时明确标注笔名与真实姓名的对应关系，并留存登记证书作为初步证据。登记机构通常要求提供身份证明、作品样本及权利声明，可形成官方认可的权属记录。

4. 合同中的权利约定
   若作品通过委托创作、合作创作或转让等方式产生，合同中应明确笔名使用与权利归属。例如：

   • 委托创作合同中约定“受托人以笔名‘XX’发表作品，著作权归委托人所有”；
     
   • 合作创作合同中明确各方的笔名使用方式及收益分配比例；
     
   • 转让合同中注明转让标的包含笔名下的作品权益。

5. 侵权纠纷中的举证责任
   若发生侵权，作者需承担初步举证责任，证明笔名与自身的关联性及作品的原创性。若证据充分，侵权方需承担停止侵害、赔偿损失等责任；若证据不足，可能面临败诉风险。因此，保留创作痕迹、发表记录及公开声明等证据至关重要。

总结建议：使用笔名发表作品时，建议通过版权登记、合同约定、公开声明等方式固定权利归属，并妥善保存创作过程证据。若遇到权属争议或侵权问题，可进一步向我咨询具体应对策略。