在查处农业违法行为时，适用《责令改正违法行为通知书》并给予执法观察期的情形，主要基于一系列明确且具体的条件。以下是对这些条件的详细阐述：
一、适用对象
首先，这一制度主要针对的是农业农村部门管辖范围内的各类农业生产经营者和相关企业，包括但不限于农业企业、农民专业合作社、家庭农场、农户，以及农资经销商和农产品初加工企业等。特别是那些符合国家和省政策导向、有发展前景的新业态新模式企业，以及列入广东省人民政府战略性支柱产业集群和战略性新兴产业集群的行业企业，在违反农业农村行政管理秩序时，若满足其他条件，也可考虑给予执法观察期。
二、适用情形
对于违法当事人，若同时满足以下条件，可给予合理的执法观察期：
违法事实确凿，法律适用明确：这意味着当事人的违法行为必须有明确的证据支持，且适用的法律法规条款清晰无误。
近两年内首次违法且危害情节轻微：当事人必须是近两年内首次违反农业农村行政管理秩序，且其违法行为的危害程度较轻，未造成严重后果。
当事人主动消除危害后果，且复查时未发现新的农业农村领域违法行为：当事人在被发现违法行为后，应主动采取措施消除或减轻危害后果，并在农业农村部门复查时，未发现新的违法行为。
三、例外规定
然而，并非所有农业违法行为都适用执法观察期制度。以下情形之一的，不适用该制度：
涉及人身安全和重大公共利益领域的违法行为：如农产品质量安全、动植物疫病防控等，这些领域的违法行为可能直接威胁到公众的生命健康和安全，因此必须严格执法，不容妥协。
经责令改正后违法行为仍持续的：如果当事人在收到责令改正通知后，仍然继续实施违法行为，说明其没有改正的意愿或能力，因此不适用执法观察期。
已适用过免罚清单或执法观察期制度，再次出现违法行为的：对于已经给予过免罚或执法观察期机会的当事人，如果再次违法，说明其没有珍惜机会，因此不再适用该制度。
拒绝、阻挠监督检查，或在接受监督检查时弄虚作假的：这些行为严重干扰了农业农村部门的正常执法工作，损害了法律的尊严和权威，因此不适用执法观察期。
擅自处理被依法查封、扣押的设施、设备或擅自撕毁封条的：这些行为属于逃避监管和处罚的恶劣行为，必须依法严惩。
违法行为涉嫌犯罪的：对于涉嫌犯罪的违法行为，必须移送司法机关处理，不能仅通过行政手段解决。
两年内被查实的有效举报投诉达三次以上，或引发群体性事件，或造成不良社会影响的：这些情形表明当事人的违法行为已经引起了广泛的社会关注和不满，必须依法严肃处理。
同一时间检查发现存在两个或以上违法行为，其中一个违法行为存在上述情形的：如果当事人同时存在多个违法行为，且其中一个违法行为属于上述不适用执法观察期的情形，那么整个案件都不适用该制度。
其他法律、法规、规章明确禁止给予执法观察期或涉及危害公共安全、侵害人民群众生命健康或严重污染环境的情形：这些情形属于法律、法规、规章的明确禁止性规定，必须严格遵守。
四、执法观察期期限与程序
给予执法观察期的时限一般在7至30个自然日之间，具体期限由农业农村部门根据案件实际情况确定。在适用程序上，农业农村部门应在立案后审查当事人是否可适用执法观察期制度，并按程序提交法制部门审核。审核通过后，由分管执法的负责人签发《责令改正违法行为通知书（给予执法观察期情形）》，明确告知当事人整改内容、要求、时限等。
综上所述，查处农业违法行为时适用《责令改正违法行为通知书》并给予执法观察期的情形是明确且具体的。农业农村部门在执法过程中应严格遵循这些条件，确保执法的公正性和有效性。