结论：公司股东一般不能就公司已进行仲裁的担保事项直接提起股东代表诉讼，但在特定情形下，如仲裁程序存在严重违法或损害公司利益且无法通过其他途径救济时，股东可能有权提起诉讼。以下为详细分析：

一、股东代表诉讼的基本原理与适用条件

股东代表诉讼，又称派生诉讼，是指当公司的合法权益受到不法侵害，而公司却怠于起诉时，符合法定条件的股东有权为了公司的利益以自己的名义直接向人民法院提起诉讼。其核心要件包括：

1. 公司利益受损：必须存在公司利益受到不法侵害的事实。
2. 公司怠于起诉：公司管理层或控股股东等未采取合理措施维护公司利益。
3. 股东资格与前置程序：股东需满足一定的持股时间或比例要求，并通常需先向公司提出书面请求，要求公司提起诉讼，公司拒绝或未在合理期限内回应后，股东方可提起代表诉讼。

二、公司担保事项已仲裁对股东代表诉讼的影响

1. 仲裁的终局性：仲裁裁决一旦作出，即具有终局性，对双方当事人具有法律约束力。若公司已就担保事项进行了仲裁，且仲裁裁决已生效，则原则上该争议已得到解决，公司利益受损的问题应已通过仲裁程序得到处理。

2. 股东代表诉讼的替代性：股东代表诉讼是公司内部救济机制失效时的补充手段。若仲裁程序已有效维护了公司利益，则股东无需再提起代表诉讼。

三、特定情形下股东可能提起诉讼的情况

尽管仲裁裁决具有终局性，但在以下特定情形下，股东仍可能有权就公司担保事项提起诉讼：

1. 仲裁程序违法：若仲裁程序存在严重违法，如仲裁员受贿、枉法裁决等，导致仲裁裁决不公正，损害了公司利益，股东可依法申请撤销仲裁裁决，并在撤销后考虑提起诉讼。

2. 公司利益未获充分救济：若仲裁裁决虽已作出，但公司利益仍未获得充分救济，如仲裁裁决未完全支持公司的诉讼请求，或裁决执行困难等，股东在符合股东代表诉讼条件的情况下，可考虑提起诉讼。

3. 公司内部救济机制失效：若公司管理层或控股股东等利用仲裁程序掩盖其损害公司利益的行为，导致公司无法通过仲裁程序有效维护自身利益，股东在符合股东代表诉讼条件的情况下，可提起诉讼以维护公司利益。

四、法律建议

1. 审查仲裁程序与裁决：股东应首先审查仲裁程序是否合法、仲裁裁决是否公正，以及公司利益是否已获得充分救济。

2. 评估股东代表诉讼的可行性：在确认仲裁程序存在问题或公司利益未获充分救济后，股东应评估自身是否符合股东代表诉讼的条件，并考虑提起诉讼的可行性与风险。

3. 寻求专业法律支持：由于股东代表诉讼涉及复杂的法律程序与实体问题，股东在提起诉讼前应寻求专业律师的法律支持，以确保诉讼的顺利进行与成功。

如有进一步疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询，我会结合你的具体情况提供更详细的法律意见。