结论：公司使用员工个人材料申请企业补贴是否合法不能一概而论，需分情况讨论。具体分析如下：

1. 若公司事先获得员工明确授权
   根据《个人信息保护法》第十三条，处理个人信息需取得个人同意。若公司已通过书面/电子形式（如劳动合同补充条款、授权书）明确告知员工：

   • 具体使用哪些材料（如身份证、学历证明、社保记录等）；
     
   • 用于申请何种补贴（如创业补贴、稳岗补贴等）；
     
   • 材料使用范围（仅用于本次申请或后续复审等），
     且员工签字确认的，该行为合法。此时公司构成“受托处理个人信息”，需严格按约定用途使用，不得擅自泄露或挪作他用。

2. 若公司未取得授权但符合法定豁免情形
   根据《个人信息保护法》第十三条第二款，若处理个人信息属于“为订立、履行个人作为一方当事人的合同所必需，或者按照依法制定的劳动规章制度和依法签订的集体合同实施人力资源管理所必需”，可能无需单独授权。例如：

   • 申请“吸纳高校毕业生就业补贴”需提交员工毕业证，属于履行劳动合同中“提供学历证明”的附随义务；
     
   • 申请“稳岗返还补贴”需提交员工社保缴纳记录，属于按劳动规章制度实施人力资源管理的必要环节。
     但需注意：公司仍需在内部规章制度中明确此类材料的使用规则，并留存补贴申请的政府文件依据，否则仍可能构成侵权。

3. 若公司未取得授权且无法定豁免情形
   若公司擅自使用员工材料申请与员工无直接关联的补贴（如以员工名义申请“企业技术改造补贴”），或未告知员工材料用途即提交申请的，构成违法。此时可能涉及：

   • 侵犯员工个人信息权益（《个人信息保护法》第十条）；
     
   • 若材料包含虚假信息，可能构成“骗取补贴”的行政违法（《财政违法行为处罚处分条例》第六条）；
     
   • 情节严重的，可能涉嫌“诈骗罪”（《刑法》第二百六十六条）。
     员工可主张：要求公司停止使用、删除材料，并可向网信部门举报或提起民事诉讼索赔。

实务建议：

• 对员工：若发现公司未经同意使用材料，可要求公司出具政府补贴申请文件及内部授权记录，若无法提供可向劳动监察部门投诉；
  
• 对公司：建议通过“一事一授权”模式（如每次申请前让员工签署《材料使用同意书》），并留存政府补贴政策依据，降低法律风险。
  

如有具体场景（如补贴类型、材料内容等），可进一步向我咨询，我会结合地方性法规为您细化分析。