二轮承包确权的耕地在三轮承包时是否有效，需视具体情况而定，但通常情况下，若三轮承包延续了二轮承包的合同内容或相关政策，则二轮承包确权的耕地在三轮承包时继续有效。以下从不同角度进行分析：

1. 合同延续性角度：

   • 在农村土地承包中，承包合同的延续是判断耕地确权是否有效的重要依据。如果三轮承包是在二轮承包的基础上，通过续签合同或政策延续的方式进行的，且合同中明确规定了耕地的承包权继续有效，那么二轮承包确权的耕地在三轮承包时自然继续有效。
   • 例如，若二轮承包合同中规定了承包期限为30年，且三轮承包时合同期限得到延长或合同内容得到确认，那么该耕地在三轮承包期间内的确权是有效的。

2. 政策规定角度：

   • 农村土地承包政策是判断耕地确权是否有效的另一重要依据。根据相关政策规定，农村土地承包经营权可以依法流转，且承包期内发包方不得调整承包地。这意味着，在承包期内，除非有法定或约定的情形，否则承包权应保持稳定。
   • 如果三轮承包政策延续了二轮承包的政策精神，即保持承包权的稳定性和连续性，那么二轮承包确权的耕地在三轮承包时也应继续有效。

3. 实际操作角度：

   • 在实际操作中，农村土地承包的确权通常需要通过颁发土地承包经营权证等方式进行确认。如果二轮承包时已经颁发了土地承包经营权证，且三轮承包时该证书未被撤销或变更，那么可以认为二轮承包确权的耕地在三轮承包时继续有效。
   • 此外，如果三轮承包时进行了新的确权登记，但登记内容与二轮承包确权内容一致，或者登记过程中确认了二轮承包确权的效力，那么该耕地在三轮承包时的确权也是有效的。

法律建议：

• 对于农民而言，应妥善保管好土地承包经营权证等确权文件，以证明自己对耕地的承包权。
• 在三轮承包过程中，应关注承包合同的签订和政策的变化，确保自己的承包权得到合法保护。
• 如果遇到承包权争议或确权问题，应及时向当地农村土地承包管理部门或法律服务机构咨询并寻求帮助。

可能法律后果：

• 如果二轮承包确权的耕地在三轮承包时被认定为无效，可能导致农民失去对耕地的承包权，进而影响其生产和生活。
• 因此，在三轮承包过程中，应确保承包权的合法性和稳定性，避免因确权问题引发不必要的法律纠纷。