关于借条上盖有公司公章，法院会如何判决的问题，这主要取决于借款的性质、用途以及公司的参与程度等多个因素，以下分情况讨论：

1. 公司作为借款人：

   • 如果借条上明确载明公司为借款人，并且加盖了公司公章，这通常意味着公司承认了这笔债务。在这种情况下，法院很可能会判决公司承担还款责任。因为公章是公司对外表示意思表示的重要凭证，加盖公章即视为公司对该借款行为的认可。

2. 公司作为担保人：

   • 若借条上表明公司是作为担保人加盖公章，那么根据《民法典》中关于担保的规定，公司需要在其担保范围内承担相应的担保责任。这通常意味着，如果借款人无法按时还款，公司需要承担还款的连带责任，但具体责任范围需依据借条中的担保条款来确定。

3. 公司员工个人借款，但加盖公司公章：

   • 如果实际上是公司员工的个人借款，但借条上却加盖了公司公章，这种情况就相对复杂了。法院在判决时，会综合考虑多个因素，如借款是否用于公司业务、公司是否从中受益、员工借款时是否得到了公司的明确授权等。
   • 如果法院认定公司并未授权员工借款，且借款也未用于公司业务，那么公司可能不需要承担还款责任。但如果法院认为公司存在过错，如管理不善导致公章被滥用，公司可能仍需承担一定的法律责任，但这种责任通常会是次要的或补充性的。

4. 其他特殊情况：

   • 还有一些特殊情况，比如借条上的公章是伪造的，或者公司已经注销、被吊销营业执照等。在这些情况下，法院会根据具体事实和相关法律规定来作出判决。例如，如果公章是伪造的，那么公司可能不需要承担任何责任；如果公司已经注销，那么可能需要追究公司股东或清算组的责任。

法律建议：

• 对于出借人来说，在签订借条时，一定要明确借款人的身份和借款用途，并要求借款人提供有效的身份证明和担保措施（如公司公章、个人财产抵押等）。同时，要仔细审查借条上的条款，确保自己的权益得到充分保障。
• 对于公司来说，要加强对公章的管理和使用审批制度，防止公章被滥用或盗用。在涉及借款等经济活动时，要谨慎决策，确保公司的利益不受损害。

可能法律后果：

• 如果法院判决公司承担还款责任或担保责任，而公司未能按时履行判决义务，那么公司可能会面临被强制执行、列入失信被执行人名单等法律后果。这不仅会影响公司的信誉和形象，还可能对公司的正常经营造成严重影响。

总结来说，借条上盖有公司公章时法院的判决结果取决于多种因素。如果你或你的公司涉及此类纠纷，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律分析和建议。