借款合同加盖银行营业部印章是否有效，需分情况讨论：

1. 银行营业部具备独立民事主体资格的情况

   • 若银行营业部已依法取得营业执照，并具备独立承担民事责任的能力（如部分银行分支机构经总行授权可独立开展业务），则其加盖印章的借款合同原则上有效。此时，营业部作为合同一方，其印章代表其真实意思表示，合同内容不违反法律强制性规定即具有法律效力。
   • 法律依据：根据《民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。银行营业部作为独立主体，其盖章行为符合合同成立要件。

2. 银行营业部不具备独立民事主体资格的情况

   • 若银行营业部未取得独立营业执照，或虽取得营业执照但无总行明确授权对外签订借款合同，则其加盖印章的行为可能因主体不适格导致合同效力存疑。此时需结合以下因素判断：
     • 总行追认：若总行事后对营业部行为予以追认，合同可认定为有效；
     • 表见代理：若相对方（借款人）有理由相信营业部有权代表银行签订合同（如营业部长期以银行名义开展业务、借款人无过错等），可能构成表见代理，合同仍有效；
     • 内部授权：若营业部虽无独立主体资格，但总行内部文件明确授权其签订借款合同，且借款人对此知情，合同亦有效。
   • 法律依据：根据《民法典》第一百七十一条，行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后，仍然实施代理行为，未经被代理人追认的，对被代理人不发生效力。但相对人有理由相信行为人有代理权的，代理行为有效。

3. 印章真实性及合同内容合法性

   • 即使营业部具备主体资格，若印章系伪造或合同内容违反法律、行政法规强制性规定（如高利贷），合同仍可能被认定为无效或部分无效。
   • 法律依据：根据《民法典》第一百五十三条，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。第一百五十四条，行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。

法律建议：

• 对借款人而言：签订借款合同前，应核实银行营业部的主体资格及授权范围，要求其提供总行授权文件或营业执照复印件，并留存盖章样本备查。
• 对银行而言：应加强对分支机构印章的管理，明确授权范围，避免因印章使用不当引发纠纷。
• 若发生争议：可依据合同约定或法律规定，通过协商、诉讼或仲裁等方式解决，并注意收集证据证明合同效力（如授权文件、印章真伪鉴定等）。

总结：借款合同加盖银行营业部印章的效力需结合营业部主体资格、总行授权、印章真实性及合同内容合法性等因素综合判断。如有具体案件或疑问，可直接向我咨询，我将结合案件细节提供专业分析。