药品批发公司不按规定物流运输药品，可能会面临多种处罚，具体取决于违规行为的性质和严重程度。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、行政处罚
警告与罚款：
- 根据《中华人民共和国药品管理法》的相关规定，药品批发公司若未按照规定进行药品运输，如未使用符合要求的运输工具、未采取必要的保温或冷藏措施等，药品监督管理部门有权责令其改正，给予警告；情节严重的，可以处以罚款。罚款的数额会根据违规行为的严重程度和造成的后果来决定，可能从数千元到数十万元不等。
没收违法所得与违法物品：
- 如果药品批发公司的违规行为涉及销售假药、劣药或者未经批准进口的药品，除了警告和罚款外，药品监督管理部门还有权没收其违法所得和违法销售的药品，并可以处以违法销售药品货值金额一定倍数的罚款。
吊销许可证：
- 对于严重违反药品管理法规的药品批发公司，药品监督管理部门有权吊销其《药品经营许可证》，禁止其继续从事药品经营活动。
二、刑事责任
生产、销售假药罪或劣药罪：
- 如果药品批发公司故意运输假药或劣药，且情节严重，可能构成生产、销售假药罪或劣药罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯此罪的，可能面临有期徒刑、无期徒刑甚至死刑的刑罚，并处以罚金或没收财产。
非法经营罪：
- 如果药品批发公司未经许可经营药品，或者违反国家规定经营限制买卖的药品，情节严重的，可能构成非法经营罪。根据刑法的规定，犯此罪的，可能面临有期徒刑或拘役，并处以罚金。
三、民事责任
赔偿损失：
- 如果药品批发公司的违规行为导致消费者或其他相关方遭受损失，如药品变质、失效等，受害方有权要求药品批发公司承担赔偿责任。赔偿的范围包括直接损失和间接损失，如医疗费用、误工费用、精神损害赔偿等。
合同违约责任：
- 如果药品批发公司与购货方签订了药品购销合同，并约定了运输方式和条件，但药品批发公司未按约定履行，可能构成合同违约。购货方有权要求药品批发公司承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
四、实际案例与启示
- 在实际案例中，药品批发公司因不按规定物流运输药品而受到处罚的情况屡见不鲜。例如，某药品批发公司因未使用符合要求的冷藏车运输需要冷藏的药品，导致药品变质失效，被药品监督管理部门处以罚款并吊销了《药品经营许可证》。这一案例警示我们，药品批发公司必须严格遵守药品管理法规，确保药品在运输过程中的质量和安全。
建议：作为药品批发公司，应严格遵守国家关于药品运输的相关规定，使用符合要求的运输工具和设备，采取必要的保温或冷藏措施，确保药品在运输过程中的质量和安全。同时，应加强与购货方的沟通和协调，明确运输方式和条件，避免因违规行为而面临法律处罚和民事责任。如果您在药品批发或物流运输方面遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。