法律咨询公司若违规代理案件，其查处部门主要取决于违规行为的具体性质和情节，但一般来说，可能涉及市场监管部门和司法行政部门的查处。以下是对此问题的详细分析：

1. 市场监管部门的查处：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》等相关法律法规，市场监管部门负责市场主体的登记管理和市场监管工作。如果法律咨询公司未经许可或超出经营范围从事代理案件等法律服务活动，这可能构成违规经营行为。
   • 查处情形：市场监管部门在发现法律咨询公司存在违规经营行为时，有权依法进行查处，包括责令改正、罚款、没收违法所得、吊销营业执照等行政处罚。

2. 司法行政部门的查处：

   • 法律依据：司法行政部门（如司法局）负责律师和律师事务所的监督管理，以及法律服务市场的规范。虽然法律咨询公司并非律师事务所，但如果其从事的活动涉及法律服务，且存在违规行为，司法行政部门也可能根据相关法律法规进行查处。
   • 查处情形：特别是当法律咨询公司以不正当手段承揽业务、虚假宣传、误导当事人等行为时，司法行政部门可能会介入调查，并依法给予行政处罚或采取其他监管措施。此外，如果法律咨询公司的行为涉嫌犯罪，如诈骗、非法经营等，司法行政部门还会将案件移送公安机关处理。

特殊情况说明：

• 如果法律咨询公司的违规行为同时涉及市场监管和司法行政两个领域，那么两个部门可能会根据各自的职责和权限进行联合查处或分别查处。
• 在实际执法过程中，各部门之间会加强协作和配合，共同维护法律服务市场的秩序和当事人的合法权益。

建议与提醒：

• 对于法律咨询公司而言，应严格遵守相关法律法规和规章制度，确保合法合规经营。如果需要从事代理案件等法律服务活动，应依法取得相应的资质和许可。
• 对于当事人而言，在选择法律咨询公司时，应仔细核查其资质和信誉情况，避免选择无资质或信誉不佳的公司。同时，在签订服务合同时，应明确双方的权利和义务，确保自身权益得到保障。

如果您在法律咨询公司代理案件方面遇到任何问题或疑虑，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况和需求，提供专业、全面的法律建议和帮助。