结论：工程款可以单独起诉主张优先权，但需满足一定条件，且优先权的行使并非必须通过诉讼途径。以下是对该问题的详细分析：
一、工程款优先权的法律依据与性质
工程款优先权，即建设工程价款优先受偿权，是承包人的一项重要法定权利。根据《中华人民共和国民法典》第八百零七条的规定，当发包人未按照约定支付工程价款时，承包人有权在合理期限内就该工程折价或拍卖的价款优先受偿。这一权利优于一般的债权，甚至抵押权，旨在保护承包人的合法权益，确保工程价款的优先支付。
二、工程款优先权的行使条件
- 合同合法有效：建设工程施工合同必须合法有效，这是承包人行使优先受偿权的基础。若合同无效，但工程质量合格，主流观点认为承包人仍可主张优先受偿权。
- 发包人违约：发包人未按约定支付工程价款，且经承包人催告后在合理期限内仍未支付。
- 工程性质适宜：建设工程需具备折价或拍卖的条件，特殊用途或不宜交易的工程可能不适用。
三、工程款优先权的行使方式
非诉讼方式：
- 协商折价：承包人可以与发包人协商，将建设工程折价以抵偿工程款。这种方式需要双方达成一致意见，并签订相关协议。
- 申请仲裁（若合同中有仲裁条款）：如果建设工程施工合同中约定了仲裁条款，承包人可以向约定的仲裁委员会申请仲裁，要求确认其工程款优先权并裁决发包人支付工程款。
诉讼方式：
- 单独起诉主张优先权：承包人可以直接向法院提起诉讼，请求法院确认其工程款优先权，并判决发包人支付工程款。在诉讼过程中，法院会审查承包人的诉讼请求、证据材料以及发包人的抗辩理由等，最终作出判决。
- 在工程款纠纷中一并主张优先权：在承包人与发包人之间的工程款纠纷诉讼中，承包人可以一并主张其工程款优先权，法院会在判决中予以确认。
四、工程款优先权的行使期限
根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第四十一条的规定，承包人应在合理期限内行使工程款优先权，最长不得超过十八个月，自发包人应当给付建设工程价款之日起算。因此，承包人需密切关注行使期限，避免丧失该权利。
五、建议与注意事项
- 及时行使权利：承包人应在法定期限内及时行使工程款优先权，避免因超过期限而丧失该权利。
- 充分收集证据：无论是通过非诉讼还是诉讼方式行使工程款优先权，承包人都需要收集充分的证据来证明其主张，如施工合同、工程结算单、付款凭证等。
- 咨询专业律师：在行使工程款优先权的过程中，承包人可能会遇到各种法律问题和挑战。因此，建议承包人咨询专业律师，以获取更具体的法律指导和帮助。
最后，工程款可以单独起诉主张优先权，但需满足一定条件，且优先权的行使并非必须通过诉讼途径。承包人应根据实际情况选择合适的行使方式，并密切关注行使期限和证据收集等问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。