针对有限责任公司停业多年后起诉股东追缴注册资金，若有股东不缴的情况，可分以下情形处理：

1. 股东出资义务的法定性
   根据《公司法》第28条，股东应当按期足额缴纳公司章程中规定的各自所认缴的出资额。即使公司停业，未履行出资义务的股东仍需承担补缴责任，且需向已足额出资的股东承担违约责任。若股东拒不缴纳，公司可通过诉讼强制执行其财产（包括银行存款、房产、车辆等），法院可查封、扣押、拍卖其资产以清偿出资。

2. 诉讼程序中的关键步骤

   • 公司需提供证据：证明股东未履行出资义务（如出资协议、验资报告、银行转账记录等），且公司曾催缴但股东未回应。
     
   • 法院判决后执行：若股东仍不履行，公司可申请强制执行，法院可将其纳入失信被执行人名单，限制高消费（如乘坐飞机、高铁，子女就读私立学校等），甚至司法拘留。
     
   • 刑事责任风险：若股东通过虚假出资或抽逃出资逃避责任，可能触犯《刑法》第159条，面临五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处虚假出资金额2%-10%的罚金。

3. 特殊情形处理

   • 股东已转让股权：若未出资股东将股权转让给第三人，原股东仍需对未出资部分承担连带责任，受让人明知或应知的需承担连带责任（《公司法司法解释三》第18条）。
     
   • 公司注销或破产：若公司已进入破产程序，管理人可追缴股东未缴出资作为破产财产；若公司注销，股东可能因未清算承担赔偿责任（《公司法》第183条）。
     
   • 出资期限未届满：若公司章程规定分期出资且期限未到，原则上股东可拒绝提前缴纳，但若公司已无法清偿债务且具备破产原因，债权人可要求股东加速出资（《九民纪要》第6条）。

4. 实务建议

   • 公司层面：及时委托律师调查股东财产线索，申请诉前财产保全，防止股东转移资产。
     
   • 其他股东层面：若已足额出资，可要求未出资股东赔偿违约损失，或通过股东会决议限制其分红权、表决权等权利（《公司法》第34条）。
     
   • 协商解决：在诉讼前可尝试与股东达成和解，例如分期缴纳、以非货币财产出资（需评估作价）等，降低执行成本。

总结：未出资股东需承担补缴责任，公司可通过诉讼强制执行；若股东拒不履行，可能面临失信惩戒、刑事责任等后果。建议公司尽快启动法律程序，并同步准备财产保全措施。如有具体证据或操作疑问，可进一步向我提供细节，我会协助制定方案。