医疗器械经营单位未及时变更质量负责人，将面临警告、罚款等行政处罚，情节严重的还可能被责令停业整顿直至吊销许可证。具体分析如下：

1. 法律依据：

   • 根据《医疗器械经营监督管理办法》第十六条，医疗器械经营许可证内容发生变化时，企业应及时向原发证部门办理变更手续。质量负责人作为关键岗位人员，其变更属于必须及时申报的事项。
   • 第四十五条明确规定，未按规定办理变更手续的，由县级以上药品监督管理部门责令限期改正，给予警告；拒不改正的，处1万元以上5万元以下罚款。

2. 处罚梯度：

   • 首次违规：通常以警告为主，要求企业在规定期限内完成变更手续。
   • 拒不改正：若企业未在限期内完成变更，将面临1万至5万元罚款。
   • 情节严重：如存在多次违规、导致医疗器械质量安全隐患等情形，可能被责令停业整顿，直至吊销《医疗器械经营许可证》。

3. 实务要点：

   • 变更时限：质量负责人变更后，企业应在30个工作日内向原发证部门申请变更。
   • 材料要求：需提交变更申请表、新质量负责人身份证明、学历或职称证明等材料。
   • 合规建议：企业应建立质量管理人员变更管理制度，确保变更流程符合法规要求，避免因程序瑕疵导致处罚。

若企业已收到整改通知或面临处罚，建议立即完成变更手续并主动与监管部门沟通，争取从轻处理。如有进一步疑问，可直接向我咨询医疗器械合规领域问题。