结论：网约车运输证有效但车辆状态注销后发生交通事故，能否要求停运损失费需分情况讨论，主要取决于事故责任归属及车辆注销状态对运营合法性的影响。以下从不同角度详细分析：

一、责任主体与赔偿依据

1. 事故责任方承担赔偿
   根据《中华人民共和国民法典》第一千一百六十五条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。若事故由对方全责或部分责任导致，对方需赔偿您的合理停运损失。

   • 法律依据：
     
     • 《民法典》第一千一百六十五条（过错责任原则）
       
     • 《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条：因道路交通事故造成下列财产损失，当事人请求侵权人赔偿的，人民法院应予支持：……（三）依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆，因无法从事相应经营活动所产生的合理停运损失。

2. 车辆注销状态的影响

   • 若注销后仍运营：车辆状态注销可能意味着网约车运输证已失效或车辆未通过年检等，此时继续运营可能构成非法营运。若事故与非法营运直接相关（如车辆故障导致），法院可能认定您存在过错，从而减轻或免除对方赔偿责任。
     
   • 若注销与事故无关：如车辆因其他原因（如过户、报废流程未完成）被注销，但事故系对方全责导致，您仍可主张停运损失，但需证明注销状态与事故无因果关系。

二、停运损失的计算与证据

1. 计算方法

   • 实际收入减少法：提供事故前3-6个月的营运流水（如平台订单记录、银行流水），扣除运营成本（燃料费、维修费、平台抽成等）后，计算日均净收入，再乘以停运天数。
     
   • 行业平均收入法：若无法提供具体收入证明，可参考当地同类型网约车的日均收入标准（需提供行业报告或统计数据）。
     
   • 停运时间认定：以车辆维修机构出具的进出厂日期证明为准，排除因您自身原因（如拖延维修）导致的延误时间。

2. 必要证据

   • 法律文件：网约车运输证（证明曾具备合法营运资格）、交通事故责任认定书（明确责任比例）。
     
   • 财务记录：近3-6个月的营运流水、成本支出凭证（如加油发票、维修发票）。
     
   • 维修证明：修理厂出具的维修记录表、进出厂时间证明。
     
   • 车辆状态证明：若注销非因您过错，需提供车管所出具的注销原因说明（如系统错误、流程延误）。

三、保险公司是否赔偿停运损失

1. 交强险：通常不赔偿间接财产损失（如停运损失），仅赔偿直接损失（如车辆维修费、医疗费）。
   
2. 商业三者险：需查看保险合同条款。若合同明确约定“停运损失免赔”，则保险公司不承担；若未约定或约定不明，可能需通过诉讼确定是否赔偿。

四、实际操作建议

1. 立即取证：事故发生后，第一时间报警并收集现场照片、对方联系方式、保险信息等。
   
2. 联系平台与车管所：向网约车平台报备事故，并咨询车辆注销的具体原因及是否可恢复运营资格。
   
3. 协商或诉讼：
   
   • 若对方全责且证据充分，可先与对方或保险公司协商赔偿；
     
   • 若协商无果，可向法院起诉，主张停运损失及其他合理赔偿（如车辆维修费、医疗费等）。

五、风险提示

• 非法营运风险：若车辆注销后仍继续运营，可能面临交通执法部门处罚（如罚款、扣车），且事故赔偿可能因非法营运被部分或全部驳回。
  
• 证据不足风险：若无法提供完整的营运流水或维修证明，法院可能酌情降低赔偿金额或驳回诉求。

总结：网约车运输证有效但车辆状态注销后发生事故，能否要求停运损失费需结合事故责任、车辆注销原因及证据充分性综合判断。建议您尽快收集相关证据，并咨询专业律师（即我本人）以制定具体维权策略。