合署办公的二层机构职工是否归法人管理，这主要取决于二层机构与法人之间的具体关系以及内部管理架构的设定。以下从几个不同角度进行分析：

1. 二层机构作为法人的内部部门或分支机构：

   • 如果二层机构是法人直接设立的内部部门或分支机构，且没有独立的法人资格，那么其职工通常会被视为法人的员工，直接接受法人的管理和监督。在这种情况下，职工的招聘、培训、考核、薪酬等人事管理事务一般由法人的人力资源部门或相关管理部门负责。

2. 二层机构作为具有独立法人资格的子公司或关联公司：

   • 如果二层机构是具有独立法人资格的子公司或关联公司，那么其职工则属于该独立法人的员工，而非直接归原法人管理。虽然原法人可能作为股东或母公司对二层机构有一定的影响力或控制权，但在法律上，二层机构拥有独立的经营管理权，包括职工的人事管理权。

3. 内部管理架构的设定：

   • 无论二层机构是否具有独立法人资格，其内部管理架构的设定也会影响职工的管理关系。如果二层机构内部设有专门的人事管理部门或岗位，且该部门或岗位被授权负责职工的人事管理事务，那么职工的管理关系可能会更加倾向于二层机构内部。然而，这并不意味着职工完全脱离了原法人的管理，特别是在涉及重大人事决策或公司政策时，原法人可能仍会保留一定的决策权或监督权。

4. 合同与协议约定：

   • 在某些情况下，二层机构与法人之间可能会通过合同或协议明确约定职工的管理关系。例如，双方可能约定职工的招聘、培训、考核等事务由二层机构负责，但薪酬、福利等事务则由法人统一管理。这种约定具有法律效力，双方应严格遵守。

建议：

• 对于合署办公的二层机构职工的管理问题，建议首先查阅二层机构与法人之间的相关合同或协议，明确双方的权利和义务。
• 如果合同或协议中没有明确约定，或者约定不明确，建议双方通过协商或补充协议的方式明确职工的管理关系。
• 在处理职工管理问题时，应遵守相关法律法规和公司内部规章制度，确保职工的合法权益得到保障。

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