与企业签订的三方协议，在考上公务员的情况下，并不当然作废，是否作废需视协议具体内容及法律规定而定。以下从不同角度为你详细分析：
一、协议内容约定优先
若协议中有明确约定：如果三方协议中明确规定了“若一方考上公务员，则协议自动作废或解除”等类似条款，那么在该方考上公务员时，协议将按照约定作废或解除。这种情况下，协议的作废是基于双方（或多方）的合意，具有法律效力。
若协议中无明确约定：如果三方协议中没有对考上公务员这一情形作出明确约定，那么协议的作废就不能直接依据协议内容来确定。此时，需要依据相关法律法规和协议的实际履行情况来判断。
二、法律法规的适用
《劳动合同法》的相关规定：虽然三方协议并非劳动合同，但其中可能涉及劳动关系的建立、变更或解除等条款。如果协议中的某些条款与《劳动合同法》的规定相冲突，那么这些条款可能被认定为无效。然而，在考上公务员的情况下，通常并不直接涉及《劳动合同法》的适用，因为公务员的录用和管理遵循的是另一套法律体系。
《公务员法》及录用规定：考上公务员后，你需要按照《公务员法》及相关录用规定办理入职手续。这通常意味着你需要与原企业解除劳动关系（如果已建立），并签订公务员录用合同。在这个过程中，如果三方协议的存在阻碍了公务员录用手续的办理，那么你可能需要与企业协商解除协议。
三、实际履行与协商解除
实际履行情况：如果三方协议已经部分或全部履行，且考上公务员并未对协议的履行造成实质性影响，那么协议可能继续有效。然而，在实际操作中，由于公务员职业的特殊性和稳定性，考上公务员的一方通常希望解除与原企业的协议关系。
协商解除协议：无论协议中是否有明确约定，考上公务员的一方都可以与企业协商解除协议。在协商过程中，双方可以就协议解除的条件、后果等事项达成一致意见，并签订书面解除协议。这种方式既尊重了双方的意愿，又避免了法律纠纷的发生。
四、可能面临的法律后果
若未经协商擅自解除协议：如果考上公务员的一方未经企业同意擅自解除协议，可能构成违约行为。根据协议约定和法律规定，你可能需要承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
若协议被认定无效或被撤销：如果三方协议存在法定无效情形（如欺诈、胁迫等）或被依法撤销，那么协议自始无效。在这种情况下，你无需承担违约责任，但可能需要就协议无效或被撤销的后果与企业进行协商处理。
建议：在考上公务员后，你应首先仔细审查三方协议的内容，了解其中关于协议解除的约定。然后，与企业进行协商，就协议解除的条件、后果等事项达成一致意见。如果无法协商一致，你可以寻求法律途径解决纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。