被除名有限合伙人的份额处理方式需结合法律规定与合伙协议约定综合判断，具体结论及处理路径如下：

1. 优先适用合伙协议约定
   根据《合伙企业法》第四十九条第三款，若合伙协议对除名后份额处理有明确约定（如折价转让、强制退伙、其他合伙人优先购买等），应优先按协议执行。例如：协议约定“被除名人需以评估价70%向执行事务合伙人转让份额”，则按此条款操作。

2. 无约定时的法定处理规则
   若协议无约定，需分两步处理：

   • 退伙结算：被除名人视为当然退伙，合伙企业应委托法定评估机构对其财产份额进行评估，按退伙结算日（除名决议生效日）的合伙企业财产状况确定退还金额。
     
   • 份额转让限制：其他合伙人享有优先购买权，若无人受让，合伙企业可办理减资或引入新合伙人承接份额。需注意：若合伙企业不具备法定减资条件（如有限合伙企业至少需2个合伙人），则必须通过转让完成份额处置。

3. 特殊情形处理

   • 损害赔偿抵扣：若被除名人因故意或重大过失给合伙企业造成损失，合伙企业可在结算时主张赔偿，直接从应退还份额中扣除（需留存损失证据及除名决议与损失的因果关系证明）。
     
   • 异议期处理：被除名人若对除名决议有异议，可在接到通知之日起30日内向法院起诉。在诉讼期间，份额处理程序暂停，但合伙企业可对份额进行保全（如冻结转让、限制分红）。

实务建议：

• 合伙协议中应明确约定除名情形（如未履行出资、竞业禁止等）及份额处理方式，避免争议；
  
• 执行除名程序时，需确保决议经法定比例合伙人同意（普通合伙需全体合伙人一致同意，有限合伙需依照合伙协议约定），并书面通知被除名人；
  
• 份额评估建议委托第三方机构，保留评估报告作为结算依据。
  

如有具体案例或协议条款需要分析，可进一步提供细节，我将为您详细解答。