个人代收工程款是否合法，需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、合法性基础与条件
存在明确的委托关系：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，个人代收工程款若基于明确的委托关系，即发包方、承包方或其他相关方出具书面委托付款授权书，明确委托个人代收工程款，且该委托关系真实、合法、有效，则个人代收工程款是合法的。
- 委托合同应明确委托事务、权限、期限等条款，确保双方权利和义务清晰。例如，委托书中应明确代收人的姓名、代收金额、代收时间等关键信息。
代收行为符合民事法律行为的有效性条件：
- 代收人需具有民事行为能力，意思表示真实，且代收行为不违反法律或行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
- 若代收行为涉及逃避债务、恶意串通或违反法律法规强制性规定，则将被视为不合法。
二、可能的风险与应对措施
非法经营风险：
- 若个人未经国家有关主管部门批准，擅自从事资金支付结算业务，包括代收工程款，可能涉嫌非法经营罪。因此，代收人需确保自身行为合法合规，避免触犯法律。
- 应对措施：在代收工程款前，务必确认自身具备合法资质，或寻求具备合法资质的机构或个人进行代收。
损害公司利益风险：
- 若代收行为涉及关联公司之间的资金往来，需避免利用关联关系损害公司利益。否则，可能违反《中华人民共和国公司法》的相关规定，并需承担赔偿责任。
- 应对措施：在代收工程款时，应确保资金使用的合法性和透明性，避免损害公司利益。
逃避债务或恶意串通风险：
- 代收行为不得用于逃避债务或恶意串通损害第三方利益。否则，代收行为将被视为不合法，并可能面临法律责任。
- 应对措施：在代收工程款时，应确保资金用途合法合规，避免涉及逃避债务或恶意串通等违法行为。
三、特殊情况下的合法性分析
政府部门或发包方代付：
- 在特殊情况下，为了保障公共利益和工程的顺利进行，政府部门或发包方可能会介入并代付工程款。若个人作为政府部门或发包方的代理人代收工程款，且该代收行为经过法定程序并确保资金使用的合法性和透明性，则是合法的。
保障农民工权益：
- 当承包方拖欠农民工工资时，政府相关部门或发包方可代付这部分费用以保障农民工的合法权益。若个人作为政府相关部门或发包方的代理人代收这部分费用，并确保资金来源的合法性和程序的规范性，则是合法的。
四、法律建议
明确委托关系：
- 在代收工程款前，务必通过书面形式（如委托协议）确认委托关系，详细列明委托事项、金额、范围等关键信息。
遵守法律法规：
- 代收人应严格遵守相关法律法规和合同约定，确保代收行为的合法性和有效性。
保留相关证据：
- 代收人在代收过程中应妥善保留付款凭证、银行转账记录等相关证据，以备不时之需。
总结来说，个人代收工程款在符合特定条件、遵循相关法律法规，并确保有明确的委托关系或合同约定时，是合法的。然而，若代收行为涉及逃避债务、恶意串通或违反法律法规强制性规定，则将被视为不合法。因此，在代收工程款时，务必谨慎操作、明确委托关系、遵守法律法规和合同约定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。