结论：在您描述的情况下，即起诉分居达到两年且对方也认可，法院在调解无效的情况下，一般会判决准予离婚。但这并非绝对，还需结合具体情况综合判断。
法律背景与依据
根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。其中，因感情不和分居满二年，调解无效的，是应当准予离婚的情形之一。
具体分析
分居原因与时间：
- 分居必须是因为感情不和而导致的，而非工作、学习等客观原因。
- 分居时间需连续且已满两年，从夫妻双方实际分开居住之日起算，并持续不间断。短暂的重聚可能会中断分居时间的计算。
对方认可的影响：
- 在您的情况下，对方认可分居事实及时间，这有助于法院认定分居的真实性和连续性。
- 对方的认可也表明双方对婚姻关系的现状有共同的认识，可能减少法院在调解过程中的难度。
法院的判断标准：
- 法院在判决离婚时，会综合考虑婚姻基础、婚后感情、分居情况等多种因素。
- 分居两年是法院判断夫妻感情是否破裂的重要参考因素之一，但并非唯一决定性因素。
- 如果法院认为双方感情确已破裂且无和好可能，特别是当存在因感情不和分居满两年的情况时，通常会判决准予离婚。
调解与审理流程：
- 法院受理案件后，会首先进行调解，尝试促使双方和解或达成调解协议。
- 如果调解无效，法院将依据双方提供的证据和法律规定进行审理，评估夫妻感情是否确已破裂。
法律建议
保留证据：
- 在分居期间，应妥善保留所有能够证明分居事实和时间的证据，如分居协议、房屋租赁合同、居委会或物业的证明、聊天记录、书信等。
- 这些证据应能清晰地证明分居的原因、起始时间和持续性，以备将来起诉离婚时使用。
准备起诉材料：
- 起草起诉状，明确诉讼请求和事实理由。
- 准备相关证据材料，包括身份证明、结婚证、分居证据等。
寻求法律帮助：
- 虽然您已经对法律有一定了解，但在处理离婚问题时，仍建议寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到妥善处理。
- 作为专业律师，我可以为您提供具体的法律意见和指导，帮助您更好地应对离婚诉讼过程中的各种问题和挑战。
可能的法律后果
- 如果法院认定双方感情确已破裂且无和好可能，特别是当存在因感情不和分居满两年的情况时，通常会判决准予离婚。
- 如果证据不足或其他因素表明感情尚未完全破裂，法院可能不会立即判决离婚。此时，您可能需要等待一段时间后再次提起离婚诉讼，或者通过其他方式证明夫妻感情确已破裂。
总之，在您描述的情况下，起诉分居达到两年且对方也认可，法院在调解无效的情况下一般会判决准予离婚。但为了确保自身权益得到妥善处理，建议您在起诉前充分准备证据材料，并寻求专业律师的帮助。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。