未依法取得施工许可证擅自施工且逾期超过2年的，将面临责令改正、罚款，情节严重的可能被责令停业整顿、降低资质等级或吊销资质证书，若构成犯罪还将追究刑事责任。具体分析如下：

1. 行政处罚的法律依据与种类
   根据《中华人民共和国建筑法》第六十四条及《建筑工程施工许可管理办法》第十二条、第十五条，未取得施工许可证擅自施工的，由县级以上人民政府建设行政主管部门责令改正，对不符合开工条件的责令停止施工，并可处以工程合同价款1%-2%的罚款。若逾期超过2年仍未补办手续，属于“情节严重”情形，可能面临更高额罚款（最高可达工程合同价款2%）、责令停业整顿、降低资质等级或吊销资质证书等处罚。

2. 处罚的裁量因素
   行政机关在处罚时会综合考虑以下因素：

   • 违法情节：如工程规模、施工时间、是否造成安全事故或质量隐患；
     
   • 主观过错：是否故意隐瞒或拒不整改；
     
   • 社会影响：是否引发群众投诉、媒体曝光或群体性事件。
     例如，若工程已接近完工且质量合格，可能从轻处罚；若存在重大安全隐患或拒不配合调查，则可能顶格处罚。

3. 后续法律义务
   即使被处罚，建设单位仍需补办施工许可证。根据《建筑工程施工许可管理办法》第十条，未取得许可证擅自施工的，在补办手续时需提交以下材料：

   • 建设工程规划许可证；
     
   • 施工场地已经基本具备施工条件的证明；
     
   • 已经确定施工企业的文件；
     
   • 有满足施工需要的资金安排、施工图纸及技术资料；
     
   • 有保证工程质量和安全的具体措施。
     若逾期未补办，工程可能被强制拆除或没收违法所得。

4. 刑事责任风险
   若未取得许可证施工导致重大安全事故，可能触犯《刑法》第一百三十七条【工程重大安全事故罪】，对直接责任人员处五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；后果特别严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

建议：若您或您的企业涉及此类问题，建议立即停止施工，主动向当地住建部门说明情况并申请补办许可证，同时配合调查以争取从轻处罚。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程及风险防范措施。