支付对方单位诉讼费没有发票，一般不能直接进行常规入账，但可以通过以下方式处理并尽量降低风险：

1. 与对方单位沟通补开发票：

   • 最直接且合规的方式是与对方单位取得联系，说明情况并要求其补开相应的发票。这是符合税法规定的做法，也能确保你的入账行为合法合规。
   • 在沟通时，可以明确告知对方单位，补开发票是双方的共同责任，也是确保交易合法性的必要步骤。

2. 利用其他凭证入账（非理想方式，需谨慎）：

   • 如果确实无法从对方单位获得发票，你可以考虑利用其他相关凭证进行入账，如法院出具的诉讼费缴纳通知书、银行转账记录等。但这种方式存在较大的税务风险，因为税法通常要求以发票作为合法的入账凭证。
   • 在使用其他凭证入账时，应确保这些凭证能够充分证明交易的真实性和合法性，并咨询专业税务人员的意见，以降低税务风险。

3. 咨询税务机关或专业税务顾问：

   • 鉴于税务问题的复杂性和专业性，建议在处理此类问题时咨询当地税务机关或专业税务顾问的意见。他们可以根据具体情况提供针对性的建议，帮助你合法合规地处理入账问题。
   • 在咨询时，应详细说明情况，包括交易背景、无法获得发票的原因等，以便税务机关或专业税务顾问能够给出准确的指导。

额外建议与风险提示：

• 加强内部管理：未来在支付类似费用时，应加强对发票等入账凭证的管理，确保在支付前就能够获得合法有效的发票。
• 谨慎选择交易对象：在与对方单位进行交易前，应对其信誉和合规性进行充分评估，避免与存在税务风险的单位进行交易。
• 关注税务法规变化：税务法规可能会随着时间和政策的变化而调整，因此应持续关注相关法规的更新，确保自己的入账行为始终符合最新要求。