确认房屋份额的判决书是可以申请执行的。以下是对此问题的详细解答：
一、执行依据
当法院对房屋产权作出部分确认的判决时，该判决即成为执行的法律依据。例如，若法院判决原告享有涉案房屋50%的产权份额，被告享有50%的产权份额，则双方应按照判决内容履行各自的义务。若一方不履行，另一方就有权向法院申请强制执行。
二、执行方式及流程
申请执行：
- 胜诉方（即获得房屋份额的一方）需在判决规定的履行期限届满后，向作出生效判决的人民法院提交强制执行申请书及相关证据材料。
- 申请书中应明确请求执行的内容，如要求对方配合办理房屋过户手续或支付相应的房屋折价款等。
法院审查与受理：
- 法院会对申请材料进行审查，确认是否符合立案条件。
- 若符合，法院将予以受理并启动执行程序。
执行措施：
- 查封、扣押、拍卖：若被执行人拒不履行判决义务，法院有权对其名下的房屋采取查封、扣押等措施，并依法进行拍卖以变现。
- 强制管理：在某些情况下，法院也可委托专业机构或个人对房屋进行强制管理，以收取租金等方式实现债权人的权益。
- 折价抵偿：经双方当事人同意，法院可将房屋折价抵偿给债权人。
过户登记：
- 若房屋被拍卖或折价抵偿给债权人，法院会协助办理相关的过户登记手续，确保房屋产权的合法转移。
三、特殊情况处理
共有房屋的处理：
- 若房屋为共同共有且不可分割，法院可能会考虑变价分割或作价补偿的方式进行处理。
- 在按份共有的情况下，法院会根据各共有人享有的份额进行分割。
唯一住房的处理：
- 即使房屋是被执行人的唯一住房，在符合一定条件下（如保障被执行人及其所扶养家属的基本居住需求），法院仍可依法进行拍卖或变卖。
案外人异议：
- 若案外人对执行标的提出书面异议，法院会进行审查。若异议成立，则会裁定中止对该标的的执行；若异议不成立，则会裁定驳回。
四、注意事项
- 遵守法律程序：在执行过程中，各方当事人应严格遵守法律程序，积极配合法院的执行工作。
- 保护合法权益：无论是申请执行人还是被执行人，都应依法维护自己的合法权益，避免采取过激行为或违法行为。
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