结论：在此类事件中，责任判定需综合考虑多方面因素，包括学校的管理责任、涉事学生的行为性质及过错程度等。以下是从不同角度对责任判定的详细分析：
学校的管理责任：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无民事行为能力人或者限制民事行为能力人在幼儿园、学校或者其他教育机构学习、生活期间受到人身损害的，幼儿园、学校或者其他教育机构应当承担侵权责任；但是，能够证明尽到教育、管理职责的，不承担侵权责任。
- 在此案例中，如果学校未能提供充分的安全保障措施，如未对校园内的危险物品进行有效管理，或者未对学生进行足够的安全教育，导致学生受伤，学校可能需要承担一定的责任。
- 具体情形：若学校在日常管理中，对笔等尖锐物品的使用和存放没有明确规定，或者未对学生进行安全教育，告知其不要随意奔跑、打闹，以免发生意外，那么学校在管理上存在疏忽，应承担相应责任。
涉事学生的行为性质及过错程度：
- 跑过来的同学作为直接侵权人，其行为（奔跑并扎到他人）显然具有过错，应当承担主要的侵权责任。
- 如果该同学是故意为之，那么其过错程度更重，可能需要承担更严重的法律责任。
- 如果该同学是无心之失，但因其行为导致了损害结果的发生，仍然需要承担一定的责任，只是责任程度可能相对较轻。
- 具体情形：若该同学在奔跑过程中，明知前方有同学手持笔，但仍未减速或避让，导致扎到对方脸部，那么其行为构成故意或重大过失，应承担主要责任。若该同学是在正常奔跑过程中，因意外情况（如突然摔倒、被其他同学碰撞）而扎到对方，那么其过错程度相对较轻，但仍需承担一定责任。
受伤孩子的自身情况：
- 如果受伤孩子自身也存在一定过错，如故意挑衅、激怒对方等，那么其也可能需要承担一定的责任。
- 但在此案例中，受伤孩子只是手持笔，并未主动挑衅或激怒对方，因此其自身过错程度较低，甚至可能不存在过错。
- 具体情形：若受伤孩子在事件发生前，对涉事同学进行了挑衅或辱骂，导致对方情绪激动而奔跑扎人，那么受伤孩子自身也存在一定过错，应承担相应责任。但若受伤孩子只是正常手持笔，并未有任何挑衅行为，则其无需承担责任。
建议：
- 在处理此类事件时，建议首先由学校组织双方家长进行协商，明确各自的责任和赔偿事宜。
- 如果协商不成，可以寻求法律途径解决，如向法院提起诉讼，由法院根据具体情况判定责任比例和赔偿金额。
- 在此过程中，建议保留好相关证据，如现场照片、视频、证人证言等，以便在需要时提供证明。
后续行动：
- 如果您需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和指导。